用于检查plink床文件的类
checkbed的Python项目详细描述
说明
这是一个检查plink.bed文件的包（移位/未移位）：
- 基本信息（个人数量、SNP数量等）
- 质量控制（检查换档是否正确）
要求
- Python3
- pip3用于安装
安装
使用setup.py
git clone https://github.com/kindlychung/checkbed.git cd checkbed python3 setup.py install
使用PIP：
来自github:
pip3 install --upgrade https://github.com/kindlychung/checkbed.git
或者来自pypi:
pip3 install --upgrade checkbed
用法
您需要将gmail帐户和密码放入~/.pygmailrc中，例如：
# suppose the main bed file is xxx.bed checkcoll xxx bedinfo xxx
更改日志
- 修正了折叠的基因型矩阵
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