cellml.recipe.api 0.7

概述

这是将使用 默认情况下启用所有选项。目前，有一些限制， 例如，构建cellml api所需的所有依赖项必须是 在使用这个配方之前安装，我不认为这会 现在在窗户下工作。

支持的选项

配方支持以下选项：

API版本

要生成的CellML API版本。有效版本生成的任何版本 通过cmake并具有python绑定（>；1.10），并且必须存在于 有效版本列表。

cmake生成器

要使用的生成器。只有默认选项Unix Makefiles是 支持，因为此配方构建在^{tt2}之上$ 它将使用make和make install。

检查生成

是否检查生成时依赖项。默认设置为关闭，因为它 没有检测到gsl库，即使它是为我安装的。 与将-DCHECK_BUILD:BOOL=OFF传递给cmake相同。

其他支持的选项：

• enable-examples
• enable-annotools
• enable-ccgs
• enable-celeds
• enable-celeds-exporter
• enable-cevas
• enable-cis
• enable-cuses
• enable-gsl-integrators
• enable-malaes
• enable-python
• enable-rdf
• enable-spros
• enable-srus
• enable-telicems
• enable-vacss

请参考CellML API Documentations了解这些选项 去吧。

用法

因为这个鸡蛋是在pypi上发布的，所以这个食谱可以马上使用 在buildout.cfg中包含一个新的部分。以下是 配置示例：

[buildout]
parts =
    ...
    cellml-api
    cellmlpy

[cellml-api]
recipe = cellml.recipe.api
api-version = 1.10

[cellmlpy]
recipe = zc.recipe.egg
eggs =
interpreter = cellmlpy
scripts = cellmlpy
extra-paths = ${cellml-api:location}/lib/python

这个例子buildout.cfg将使用 已启用支持的选项，将在中生成脚本 bin/cellmlpy，它将允许在没有 设置PYTHONPATH和其他相关环境变量。 有关更多详细说明，请参阅示例目录 以及这个配方的其他示例用法。

版权/许可信息

这个软件是在mpl/gpl/lgpl许可下发布的。

有关详细版权，请参阅文件COPYING.txt。 信息，以及docs目录中的特定许可证 软件发布于。

0.7（2019-01-23）

• 更新分发位置。

0.6（2018-07-31）

• python 3兼容性。

0.5（2018-01-23）

• 在github上添加了最新版本的cellml api。
• 将运行路径添加到位。

0.4（2012-11-05）

• 添加了CellML API 1.12。

0.3（2012-10-03）

• 更正了telicem标志的输入错误。
• 添加了CellML API 1.11。

0.2（2011-09-21）

• 修复了将所有预期密钥分配给 空字符串，即使未赋值；这会导致各种不需要的边 影响。
• 修复了此构建方法的位置为 未定义。

0.1（2011-09-21）

• cellml api python绑定构建的初始版本。

演示

这个配方在zc.recipe.cmmi上扩展，并在 调用cmake而不是./configure脚本，但是有cmake 生成Unix Makefiles，使make/make install CMMI调用将正常进行。

为了演示，我们没有下载/构建整个api 将使用模型（这是以前的设置）。

>>> ls(distros)
-  cellml-api-0.0fake.tgz

>>> distros_url = start_server(distros)
>>> archive_url = '%scellml-api-0.0fake.tgz' % distros_url

让我们创建我们的构建，但修改，以便使用我们的假存档。

>>> write('buildout.cfg',
... """
... [buildout]
... parts = cellml-api
...
... [cellml-api]
... recipe = cellml.recipe.api
... api-version = 0.0fake
... """)

由于我们的模拟API版本未列为可用版本， 建筑会死的。

>>> print('start ' + system(buildout))
start...
  Installing.
  Getting ... cellml-api.
  Initializing ... cellml-api.
...
Traceback (most recent call last):
...
ValueError: api-version `0.0fake` is not a supported version of...
<BLANKLINE>

好吧，既然我们的假版本显然不会被添加到 列出支持的api，我们仍然可以提供url和md5sum 由zc.recipe.cmmi提供的原始函数仍然有效。 使用所需的属性重写buildout.cfg。

>>> try: from hashlib import md5
... except ImportError: from md5 import new as md5
>>> m = md5(open(join(distros, 'cellml-api-0.0fake.tgz'), 'rb'
...             ).read()).hexdigest()
>>> write('buildout.cfg',
... """
... [buildout]
... parts = cellml-api
...
... [cellml-api]
... recipe = cellml.recipe.api
... url = %s
... md5sum = %s
... """ % (archive_url, m))

>>> print('start ' + system(buildout))
start...
...
CMake Warning:
  Manually-specified variables were not used by the project:
<BLANKLINE>
    CHECK_BUILD
    ENABLE_ANNOTOOLS
    ENABLE_CCGS
    ENABLE_CELEDS
    ENABLE_CELEDS_EXPORTER
    ENABLE_CEVAS
    ENABLE_CGRS
    ENABLE_CIS
    ENABLE_CUSES
    ENABLE_EXAMPLES
    ENABLE_GSL_INTEGRATORS
    ENABLE_MALAES
    ENABLE_PYTHON
    ENABLE_RDF
    ENABLE_SPROS
    ENABLE_SRUS
    ENABLE_TELICEMS
    ENABLE_VACSS
<BLANKLINE>
<BLANKLINE>
<BLANKLINE>