用应答集编程推理逻辑信令网的响应
caspo的Python项目详细描述
逻辑信令网络响应的推理
人工识别生物系统背后的逻辑规则通常是困难的、容易出错的和耗时的。此外,研究还表明,如果考虑固有的实验噪声,许多不同的逻辑网络可以与一组实验观测相兼容。 因此,从实验数据中自动推断逻辑网络的将允许识别可接受的大规模逻辑模型,从而节省大量工作,并且没有任何先验偏差。接下来,一旦确定了一个a族逻辑网络,就可以建议或设计新的实验,以减少该族提供的不确定性。最后,我们可以寻找干预策略,迫使一组目标物种或化合物进入所需的稳定状态。总之,这构成了逻辑信令网络上自动推理的管道。因此,caspo的目标是实现这样一个管道,为系统生物学家提供一个强大且易于使用的软件工具。
文件
有关如何安装和使用caspo的详细文档如下 可在http://caspo.readthedocs.io购买
样品
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