可视化CAMI分析输出的工具集合
CAMIViz的Python项目详细描述
摄像机视觉化 可视化CAMI分析输出的工具集合
#安装 使用conda `bash conda config --add channels defaults conda config --add channels bioconda conda config --add channels conda-forge conda create -c etetoolkit -y-n CAMIViz python=3.7 numpy ete3 seaborn pandas matplotlib biom-format conda activate CAMIViz `
#示例用法 `bash python src/profile_to_plot.py -i data/prediction_multi.profile -g data/ground_truth_multi.profile -b test -s sample_0 genus ` 这将产生一个图,该图直观地表示由许多分类概要分析方法生成的分类概要文件的相对丰度。可以在[此处](https://github.com/dkoslicki/CAMIProfilingVisualization/blob/master/data/test_tree_genus.png)找到示例图
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