混合两个pdb文件以创建solvate
blendpdb的Python项目详细描述
BrdPdB是一种混合两种物质以制备溶剂如50%<Br/>乙醇的工具。< BR> > BR/> > -BR/----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------BLDENDPDB/B/S安装“使用”>“使用”:“使用”:“使用”选项“混合百分比”(v/v),与“选项”:“选项”显示,--config=file
从文件加载配置(默认为.blendrc')
-v,--详细打印信息
-n,--dry不创建混合pdb('-v'将自动设置为
-o file,--output=file
将混合pdb输出到文件(默认
<;percentage>;p_lt;sub戋b>;.pdb)
`blendrc`
——在工作目录中创建“blendrc”文件,比如文件表明物质
tfe:名称
长名称:2,2,2-三氟乙醇长名称
密度:1.393密度(g/cm^3)
分子量:100.04分子量(g/mol)
pdb:tfe.pdb pdb文件指示物质
blendpdb也尝试在主目录中加载`.blendrc`文件。
从文件加载配置(默认为.blendrc')
-v,--详细打印信息
-n,--dry不创建混合pdb('-v'将自动设置为
-o file,--output=file
将混合pdb输出到文件(默认
<;percentage>;p_lt;sub戋b>;.pdb)
`blendrc`
——在工作目录中创建“blendrc”文件,比如文件表明物质
tfe:名称
长名称:2,2,2-三氟乙醇长名称
密度:1.393密度(g/cm^3)
分子量:100.04分子量(g/mol)
pdb:tfe.pdb pdb文件指示物质
blendpdb也尝试在主目录中加载`.blendrc`文件。