biob_structure\u utils是biob模块集合，用于对三维结构执行基本操作。
biobb-structure-utils的Python项目详细描述
生物结构
简介
biob_structure\u utils是biob模块集合，用于修改或从PDB结构文件中提取信息，例如拉出特定的模型或链，移除水分子或配体，或重新编号或排序原子或残留物。Biobb（BioExcel构建块）包是Python构建块，在流行的生物信息学工具上创建新的兼容性和互操作性层。本软件包的最新文档可在我们的readthedocs网站上找到： latest API documentation。在
版本
v3.0.1 2020.3版
安装
使用PIP：
Important: PIP only installs the package. All the dependencies must be installed separately. To perform a complete installation, please use ANACONDA, DOCKER or SINGULARITY.
- 在
安装：
在pip install "biobb_structure_utils>=3.0.1" - 在 在
使用水蟒：
- 在
安装：
^{pr2}$ 在 - 在
用法：对于conda安装，BioBBs可以与Python API documentation和{a9}一起使用
在
使用DOCKER：
- 在
安装：
在docker pull quay.io/biocontainers/biobb_structure_utils:3.0.1--py_0 - 在
用法：
在docker run quay.io/biocontainers/biobb_structure_utils:3.0.1--py_0 <command>
使用奇点：
MacOS users：强烈建议避免单一性，并使用Docker作为集装箱化系统。在
- 在
安装：
在singularity pull --name biobb_structure_utils.sif shub://bioexcel/biobb_structure_utils - 在
用法：
在singularity exec biobb_structure_utils.sif <command>
命令列表和规范可以在Command Line documentation找到。在
版权与许可
本软件是在BSC&；IRB为European BioExcel开发的，由欧盟委员会（EU H2020823830，EU H2020675728）资助。在
- （c） 2015-2020年Barcelona Supercomputing Center
- （c） 2015-2020年Institute for Research in Biomedicine
根据 Apache License 2.0，有关详细信息，请参阅文件许可证。在
确认
该软件使用函数读取和修改基于MIT下的蔡志坤（caizkun@gmail.com）创建的GROPY库中的GRO文件。在这个项目中，GROPY已经适应了Python3和我们自己的需要。在
- 项目
标签：
欢迎加入QQ群-->： 979659372
