一种生成核苷酸组成匹配的DNA序列的工具
biasawa的Python项目详细描述
使用pip安装
BiasAway也可以在PyPi上通过pip进行安装。在
^{pr2}$BiasAway是用Python和Python包biopython和numpy开发的。pip和{tt1}$都将安装这些依赖项,您可以使用BiasAway了。它使用Python版本3.4、3.5、3.6和3.7进行测试。在
从源安装BiasAway
您可以使用gitfrom bitbucket安装开发版本。在
从Bitbucket安装开发版本
如果您安装了git,请使用以下命令:
git clone https://bitbucket.org/CBGR/biasaway.git
cd biasaway
python setup.py sdist install
如何使用BiasAway
安装biasaway后,可以键入:
biasaway --help
{{tt14},这四个{tt14},这将显示^/tt15子命令^/12。在
usage: biasaway <subcommand> [options] positional arguments <subcommand>: {k,w,g,c} List of subcommands k k-mer shuffling generator w k-mer shuffling within a sliding window generator g %GC distribution-based background chooser c GC distribution and %GC composition within a sliding window background chooser optional arguments: -h, --help show this help message and exit -v, --version show program's version number and exit
要查看六个子命令k、w、g和c类型的帮助:
biasaway k --help biasaway w --help biasaway g --help biasaway c --help
交互式web服务器
BiasAway web服务器在:http://biasaway.uio.no免费提供
支持
{21$或程序中发现任何问题,请在
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