bgen文件格式读取器
bgen-reader的Python项目详细描述
bgen阅读器
一个bgen file format阅读器
bgen是一种用于存储大型遗传数据集的文件格式。 它同时支持无相基因型和有变量的相单倍型数据 倍性和等位基因数。它的目的是提供一个紧凑的数据 不牺牲变量访问性能的表示
这个python包是bgen library的包装， 一种低内存占用率的读取器，能有效地读取bgen文件。 完全支持bgen格式规范：1.2和1.3； 以及它们可选的压缩格式。
安装
它可以通过conda安装
conda install -c conda-forge bgen-reader
或通过pip
pip install bgen-reader
文件
请参阅https://bgen-reader.readthedocs.io。
故障排除
致命错误：bgen.h:没有这样的文件或目录
这意味着bgen c库未安装（或找不到）。拜托， 按照https://github.com/limix/bgen中的说明安装，然后尝试 再次安装bgen读卡器。
问题
如果您遇到任何问题，请submit it。
作者
许可证
这个项目是根据MIT License授权的。
欢迎加入QQ群-->： 979659372
