大分子络合物具体描述工具包

bcforms的Python项目详细描述


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BcForms:具体描述大分子络合物的工具包

BcForms是一个用于具体描述分子 大分子配合物的结构(原子和键),包括 非规范单体形式、圆形拓扑和交联。

BcForms包含五个工具:*一个具体的 描述的亚基组成和链间交联 生物复合物。见 documentation了解更多 信息。例如,以下文本表示同二聚体 在第一单体和第一单体之间有二硫键的络合物 亚单位和第二亚单位中的第一单体。 complex: 2 * sub_c | x-link: [         l-bond-atom:sub_c(1)-1S11 |         l-displaced-atom:sub_c(1)-1H11 |         r-bond-atom:sub_c(2)-1S11 |         r-displaced-atom:sub_c(2)-1H11       ]

This concrete representation enables the `BcForms` software tools to calculate properties of biocomplexes when the subunits are concretely defined.

安装

  1. 安装依赖项
  1. 安装pypi的最新版本pip install bcforms.git[all]
  2. 安装github的最新版本 pip install git+https://github.com/KarrLab/bcforms.git#egg=bcforms[all]

文件

请看API documentation

许可证

该包在MIT license下发布。

开发团队

这个包是由Karr Lab开发的 在美国纽约西奈山的伊坎医学院。

问题和评论

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