用于轻松地从cli批量运行cutadapt的包装器。
BatchAdapt的Python项目详细描述
在批处理模式下运行cutadapt(http://cutadapt.readthedocs.io/en/stable/)的最小包装。 为格拉斯哥大学的蒙克顿小组设计,所以在这个程序中,我们可能会对我们的miseq数据的标注方式有特定的行为。 我真的记不起来了。
安装
python setup.py install or pip install batchadapt
用法
示例用法:
$ batchadapt [-h/–help] [-v] [-i INPUT] [-o OUTPUT] [-fwfp AAAAA] [-rvfp GGGGG] [-e 0] [-ov 10]
参数
使用“-help”参数运行batchadapt,以获得每个参数的详细解释。