用于轴突和髓鞘自动分割的python工具

AxonDeepSeg的Python项目详细描述


#轴测图

[![活页夹](https://mybinder.org/badge.svg)](https://mybinder.org/v2/gh/neuropoly/axondeepseg/master?filepath=notebooks%2Fgetting_started.ipynb) [![生成状态](https://api.travis-ci.org/neuropoly/axondeepseg.svg?branch=master)](https://travis-ci.org/neuropoly/axondeepseg) [![文档状态](https://readthedocs.org/projects/axondeepseg/badge/?version=stable)](http://axondeepseg.readthedocs.io/en/stable/?徽章=稳定) [![覆盖状态](https://coveralls.io/repos/github/neuropoly/axondeepseg/badge.svg?branch=master)](https://coveralls.io/github/neuropoly/axondeepseg?分支=主)

利用深度学习从显微镜数据中分离轴突和髓鞘。用python编写。使用tensorflow框架。 基于卷积神经网络结构。像素分为轴突、髓鞘或背景。

有关详细信息,请参见[文档网站](http://axondeepseg.readthedocs.io/)。

啊![alt标记](https://github.com/neuropoly/axondeepseg/blob/master/docs/source/_static/fig0.png

##帮助

如果在安装和/或使用axondeepseg期间遇到问题,可以在[axondeepseg github issues网页](https://github.com/neuropoly/axondeepseg/issues)上发布新问题。我们会尽快给你答复的。

##引文

如果您在研究中使用此项工作,请按如下方式引用:

Zaimi,A.,Wabartha,M.,Herman,V.,Antonsanti,P.-L.,Perone,C.S.,&Cohen Adad,J.(2018年)。轴突成像:利用卷积神经网络从显微镜数据中自动分割轴突和髓鞘。科学报告,8(1),3816。链接到纸张:https://doi.org/10.1038/s41598-018-22181-4

版权所有(c)2018 Neuropoly(Polytechnique Montreal)

##许可证

麻省理工学院许可证(MIT)

版权所有(c)2018 Neuropoly,埃科尔理工大学,蒙特勒大学

特此免费授予获得本软件副本和相关文档文件(以下简称“软件”)的任何人使用本软件的权利,包括但不限于使用、复制、修改、合并、发布、分发、再授权和/或出售本软件副本的权利,并在符合以下条件的情况下,允许向其提供软件的人员这样做:

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##贡献者

<> Pierre Louis Antonsanti、Mathieu Boudreau、Oumayma Bounou、Julien Cohen Adad、Victor Herman、Melanie Lubrano、Christian Perone、Christian Perone、Y。

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