用于轴突和髓鞘自动分割的python工具
AxonDeepSeg的Python项目详细描述
#轴测图
[![活页夹](https://mybinder.org/badge.svg)](https://mybinder.org/v2/gh/neuropoly/axondeepseg/master?filepath=notebooks%2Fgetting_started.ipynb) [![生成状态](https://api.travis-ci.org/neuropoly/axondeepseg.svg?branch=master)](https://travis-ci.org/neuropoly/axondeepseg) [![文档状态](https://readthedocs.org/projects/axondeepseg/badge/?version=stable)](http://axondeepseg.readthedocs.io/en/stable/?徽章=稳定) [![覆盖状态](https://coveralls.io/repos/github/neuropoly/axondeepseg/badge.svg?branch=master)](https://coveralls.io/github/neuropoly/axondeepseg?分支=主)
利用深度学习从显微镜数据中分离轴突和髓鞘。用python编写。使用tensorflow框架。 基于卷积神经网络结构。像素分为轴突、髓鞘或背景。
有关详细信息,请参见[文档网站](http://axondeepseg.readthedocs.io/)。
啊![alt标记](https://github.com/neuropoly/axondeepseg/blob/master/docs/source/_static/fig0.png)
##帮助
如果在安装和/或使用axondeepseg期间遇到问题,可以在[axondeepseg github issues网页](https://github.com/neuropoly/axondeepseg/issues)上发布新问题。我们会尽快给你答复的。
##引文
如果您在研究中使用此项工作,请按如下方式引用:
Zaimi,A.,Wabartha,M.,Herman,V.,Antonsanti,P.-L.,Perone,C.S.,&Cohen Adad,J.(2018年)。轴突成像:利用卷积神经网络从显微镜数据中自动分割轴突和髓鞘。科学报告,8(1),3816。链接到纸张:https://doi.org/10.1038/s41598-018-22181-4。
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##许可证
麻省理工学院许可证(MIT)
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<> Pierre Louis Antonsanti、Mathieu Boudreau、Oumayma Bounou、Julien Cohen Adad、Victor Herman、Melanie Lubrano、Christian Perone、Christian Perone、Y。