绘制一组cryoEM粒子覆盖的欧拉角的二维直方图。
angdist的Python项目详细描述
焦虑症
绘制一组冷电磁粒子覆盖的欧拉角的二维直方图。在
单粒子冷冻电磁重建来自于一组粒子图像
对应于相同粒子在不同方向上的投影。
知道有多少粒子对给定的投影方向有贡献
评估数据集质量很重要。此命令行工具生成
来自的run_*_data.star文件中粒子方向的二维直方图
RELION Class3D或Refine3D作业。在
这个工具用RELION-3.1.0生成的star文件进行了测试。早期版本 不支持RELION。在
常见问题解答
Q:RELION不是已经这样做了吗？在
A:RELION-3.1生成欧拉角的直方图，但是是三维的
（*_angdist.bild个文件）。这是非常方便的视觉联系具体
Euler与三维重建的相应方向成角度
微粒。这个工具是对浮雕的补充，因为它产生了一个二维
直方图。二维直方图更易于全局查看，因此
快速发现问题（缺少方向，强烈偏好的方向，
等等）。这个工具不需要安装RELION，可以
从其他计算机快速检查文件。此工具还允许您调整
柱状图中的箱数，并将柱状图另存为SVG文件
（这有助于调整造型，使身材更漂亮）。在
Q:冰晶石公司不是已经这样做了吗？在
A:是的，cryoSPARC已经打印出了完全相同的柱状图。这个工具， 但是，不需要安装冰晶石，可以检查 从另一台计算机快速生成文件。此工具还允许您调整 柱状图中的箱号，并将柱状图另存为SVG文件（即 有助于调整造型，打造漂亮身材）。最后，这个工具使用 对于色盲者来说，比 冰晶石公司使用的一种。在
致谢
如果没有
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安装
$ pip install angdist
使用
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