abagen 0.0.1

概述

2013年，艾伦脑科学研究所发布了艾伦人脑 Atlas，a dataset包含微阵列 从6个人脑中收集的表达数据。此数据集提供了 史无前例的检验人类基因基础的机会 大脑，已经产生了新的见解，例如adolescent brain development和functional brain organization。

然而，为了在大多数分析中有效地使用，ahba微阵列 表达式数据通常需要（1）折叠成感兴趣的区域（例如， （2）在捐赠者之间合并今年五月 在这些步骤中，有许多分析选择，可能看起来微不足道 这会极大地影响结果数据和任何下游分析。 实际上，Arnatkevi_i_te等人，2018（[1]）对 这在recent manuscript中演示了如何使用技术和代码来准备raw AHBA的数据在已发表的报告中有很大差异

当前的Python包abagen旨在提供一个可复制的管道 用于处理和准备用于分析的AHBA微阵列表达数据。 如果您想了解有关该软件包的更多信息，包括如何安装它 还有一些关于它使用的示例说明，请查看我们的documentation！

开发和参与

这个软件包主要是在一个毕业生的业余时间开发的 学生（@rmarkello）在一些人的帮助下 难以置信的contributors如果有其他人 在研究生院有限的时间限制下， 当前包当前不接受新功能的请求

但是，如果你有兴趣参与这个项目，我们 很高兴欢迎新的贡献者你应该先看看我们的 contributing guidelines和code of conduct。一旦你做完了，看看 我们的issues看看是否有 任何你想做的事。或者，如果你发现了一个bug， 遇到问题，或者有问题，用一些 关于它的信息！

致谢

虽然该计划最初是在2018年初制定的，但目前 项目中的功能受 Arnatkevi_i_te等人，2018年。因此，如果您使用此代码 若要（1）提供指向abagen存储库的链接，其中包含 使用的代码，以及（2）引用他们的论文：

许可证信息

此代码库是根据3条款BSD许可证授权的。完全许可证可以 在abagen发行版的LICENSE文件中找到。

此处提及的所有商标均为其各自持有人的财产。