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我试图将a[i]列表中的新更改替换为原始er.pdb文件
使用文件中的数字&；列表中的项目
下面是列表中项目的外观示例
['ATOM 168 N MET A 48 6.6 ...
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我有一个文件，它将10段数据存储到一个文件中（我们将这些文件称为10S）。通常，每个部分都会获得其单独的文件。我想将每个部分附加到另一个文件中，但我需要将以前编写的文件复制10次（每个数据部分复制一次 ...
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我目前正在解析由蛋白质口袋和配体分子组成的PDB文件。
每个配体的残基名称设置为“UNL”，PDB文件如下所示：
HETATM 82 C UNL 1 26.597 -14. ...
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water = water.readlines( ...
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我只得到了第一个输入文件正确的输出，但是我在第一个文件中有一个，B，C，D链，并且得到了正确的输出，在这种情况下，在第二个输入文件中没有C和D链在这种情况下，我们的代码复制了C和D的第一个文件数据的相 ...
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我编写了一个python脚本，从CIF文件生成字典。我用这样一个文件进行了测试，这个文件有4105行->时间：383ms（毫秒）]或这个文件（1d66，3274行-gt；时间：225ms），但是当我用 ...
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NameError: name 'startnum' is not defined
我以前用过这个代码。但现在它给了错误
import sys
if(len(sys.argv) == ...
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我正在尝试用python打印pdb输入文件中的预定义序列，但没有得到预期的结果。我是python新手，我也有import目录，但它不工作。没有显示任何内容（找不到错误）。它只是运行没有任何输出。你知道 ...
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我有一个像这样的数据文件。在
HETATM 1 H10 XSHQ 0 10.139 2.231 0.091 1.00 0.00 H
HETATM ...
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我无法使用scipy的kd树从pdb文件中查询模型的最近邻。我目前已经实现了一种暴力方法，在这种方法中，我将每个模型的rmsd值与其他模型进行比较。我想通过使用kd-tree来加快查找每个模型最近邻所 ...
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我想增加更多的段落，但得到错误？我可以打印前三段，但当我试图增加更多的段落得到错误。有人能纠正一下吗？你知道吗
输入文件：
HETATM10910 C4B NAD A 363 60.856 ...
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