多处理池方法的性能问题我在一个数据框中有一列,它由一个项目列表组成,我想基于Fisher精确测试计算该数据框的行(在本例中是列表)与所有其他行的相似性。为此,我想使用python multiprocessing中的Pool ...2024-04-20 已阅读: n次
大数据矩阵的Pearson相关和P值python这就是我现在的问题。我有一堆大数据矩阵~500x30000。我需要计算皮尔逊相关系数,以及它是否有显著的p值。scipy.stats.pearsonr不处理矩阵,因此我编写了以下函数来计算相关性和p值 ...2024-04-20 已阅读: n次
t测试1放大器给出的P_值错误以下是一个单样本t检验示例: from scipy.stats import ttest_1samp import numpy as np ages = [32., 34., 29., 29., 2 ...2024-04-20 已阅读: n次
对多组进行方差分析我有以下数据帧: 我想用这段代码来比较我的整个数据帧之间的平均值: F_statistic, pVal = stats.f_oneway(percentage_age_ss.iloc[:,0:1], ...2024-04-20 已阅读: n次
如何在Python中实现R的p.adjust我有一个p值列表,我想为FDR的多次比较计算调整p值。在R中,我可以使用: pval <- read.csv("my_file.txt",header=F,sep="\t") pval < ...2024-04-20 已阅读: n次
从多个列中筛选和替换我有一个文件,我必须用NA替换大于0.05的pvalue(pval > 0.05),换句话说,保留pval < 0.05,用NA替换p val > 0.05。你知道吗 例如: Rv_ ...2024-04-20 已阅读: n次
为什么Fortran中的一元Horner比NumPy的更快,而二元Horner是n我想用Python执行多项式演算。numpy中的polynomial包对我来说不够快。因此,我决定重写Fortran中的几个函数,并使用f2py创建可轻松导入Python的共享库。目前,我正在对照nu ...2024-04-20 已阅读: n次
数据库更新时更新的Django模型属性我是一个django初学者,试图建立一个django项目进行数据分析。某一类型实验的数据由两个模型“Dataset”和“GeneEntry”表示,其中每个数据集代表一个实验,每个GeneEntry代表 ...2024-04-20 已阅读: n次
删除布尔值大家好(我是python新手) 我们得到了一个file.tsv,我们需要构建一个函数。其中之一是,如果一列(这里称为“low_confidence_variant”)为True,则删除每一行。我不知怎 ...2024-04-20 已阅读: n次
Python代码示例优化我正在查看scipy.stats中Kolmogorov-Smirnov测试的实现,看到了以下代码: D = np.max([Dplus,Dmin]) if mode == 'asymp': r ...2024-04-20 已阅读: n次
Python的p值来自tstatistic给出的nan我有一些t值和自由度,想从中找出p值(它是双尾的)。在现实世界中,我会使用统计学教科书后面的t-test表;但是,我使用的是python中的stdtr或stats.t.sf函数。对于小自由度来说,这两 ...2024-04-20 已阅读: n次
Python删除同一索引中多个子列表的元素我正在为我工作的实验室开发一种分析生物数据的算法,但我觉得有点卡住了。这个想法是比较从一个csv文件中包含相同类型数据的几个经验 我根据sublist(也是长度为3的列表)中元素中的一个值来过滤列表, ...2024-04-20 已阅读: n次