Biopython:reseq与pdb-fi不匹配我有一个PDB文件,我需要提取它的剩余序列号(resseqs)。根据对PDB文件(粘贴在下面)前几行的手动检查,我认为resseqs应该是{}。然而,Biopython的^{}模块提出了其他建议(输出 ...2024-05-23 已阅读: n次
请建议Pandas数据框架的结构我有许多json文件,格式如下。我想把它们都加载到一个pandas数据帧中,在那里我计划绘制直方图、绘图、做算术运算,甚至用sciket learn做一些聚类。你能不能建议一种加载所有数据帧的方法,以 ...2024-05-23 已阅读: n次
在datafram中创建一行我正在尝试在现有数据帧中创建一行,新行的值应该是一个计算 我有一个如下所示的数据帧: Rating LE_St % Total 1.00 7.58 74.55 2.00 ...2024-05-23 已阅读: n次
翻译我的序列?我必须写一个脚本来翻译这个序列: dict = {"TTT":"F|Phe","TTC":"F|Phe","TTA":"L|Leu","TTG":"L|Leu","TCT":"S|Ser","TCC" ...2024-05-23 已阅读: n次
如何在Python中从空格分隔的文件中提取特定列?我正在尝试处理蛋白质数据库中的一个文件,该文件由空格(而不是\t)分隔。我有一个.txt文件,我想提取特定的行,从这些行中,我只想提取几列。 我需要用Python来做。我首先尝试使用命令行,使用awk ...2024-05-23 已阅读: n次
对一个集合进行排序,每个元素有四条数据我有一套: {'6HUP ILE 228 D', '6HUP PHE 289 B', '6HUP PRO 233 D', '6HUP MET 286 E', '6HUP THR 237 A', '6H ...2024-05-23 已阅读: n次
正则表达式匹配考试结果这是关键结构 first part + '-' + second part 第一部分是指标清单 'BIL|UBG|LEU|ERY|pH|KET|SG|PRO|NIT|GLU' 第二部分是int+“ ...2024-05-23 已阅读: n次
如何使用字典来输出一个按要求输入的字典键我对编码相当陌生,所以我不太懂术语,但我正在尝试使用这本词典。我很好奇为什么一个版本有效,而另一个却不行。当我输入第一个字典键(379048997)时,第一个代码不输出任何值,但第二个输出实际值 Pe ...2024-05-23 已阅读: n次
用numpy计算集合平均值的一种好方法我试图计算由某一列标识的两个数据集的平均值。这里是AA2列。简单的解决方案是首先识别数据集,然后计算该数据集的平均值。然而,在python中这看起来不太好。有没有办法让纽比帮我?在 我的数据集: ...2024-05-23 已阅读: n次
Python将RNA序列转换成单字母氨基酸序列我需要一些帮助来写一个代码,将一个给定的RNA核苷酸序列转换成氨基酸序列。在 我现在得到了两个字典可以使用:一个是氨基酸密码子和它们各自的3个字母代码,一个是3个字母的代码和它们对应的1个字母代码。在 ...2024-05-23 已阅读: n次
找到停止密码子我想在我的CD里找到起始密码子和终止密码子。我使用过正则表达式,但是当我运行这个python脚本时,我得到了一个空的stop密码子列表。非常感谢任何帮助。在 std_code = {"TTT":"F| ...2024-05-23 已阅读: n次
通过匹配来自不同列和不同行的值来创建新列python pandas我有一个多列测向仪,大约有2000行。 df如下所示: site le_cell le_id ca ca_id 1 101 1011 1 NAN ...2024-05-23 已阅读: n次