以in-if语句结尾和开头:Python 3我是python新手,我必须创建一个程序来验证DNA序列。 (关于DNA序列的背景非常迅速) 为了有效: •字符数可被3整除 •前3个字符是ATG •最后3个字符是TAA、TAG或TGA。 我的问题是 ...2024-04-20 已阅读: n次
将核苷酸翻译成氨基酸的Python我有一个不起作用的函数。我必须将.txt文件中的核苷酸序列翻译成氨基酸,比较字符串和字典。有人能告诉我这有什么问题吗?输出仅显示.txt文件中的字符串,它被选为该文件中的氨基酸序列 f = open( ...2024-04-20 已阅读: n次
Python寻找最长的ORF有人能给我一个简单的方法来计算最长的开放阅读框(ORF)>;DNA序列的长度是30个碱基?ATG是起始密码子(即ORF的开始),TAG、TGA和TAA是终止密码子(即ORF的结束)。没有使用生物 ...2024-04-20 已阅读: n次
在Python中使用regex查找字符串中以给定子字符串开头和结尾的所有字符串 我已经给了一根绳子 ATGCCAGGCTAGCTTATTTAA 我要找出字符串中所有以ATG开头,以TAA,TAG,TGA结尾的子字符串。你知道吗 以下是我正在做的: seq="ATGCCA ...2024-04-20 已阅读: n次
python3,用request(library)填写表单,返回相同的页面HTML,而不输入参数我试图使用请求在https://www.doleta.gov/tradeact/taa/taa_search_form.cfm上填写一个表单,并返回打开的新页面的HTML并从新页面提取信息。在 这是相 ...2024-04-20 已阅读: n次
如何在字典中的两个短字符串之间得到一个字符串。。。Python早上好。 我有一个字典(在python中),其中键作为名称,值作为dna序列('acgt…')。我需要从这个字典的值中得到两个特定的三个字母之间的所有字符串('atg'作为起始点,'taa'、'aag ...2024-04-20 已阅读: n次
在字符串中搜索模式我需要找到一个模式ATG[任何数量的任何字符三胞胎][TGA或TAG或TGA],其中我只需要第一个ATG,进一步到[TGA或TAG或TAA]没有关系。你知道吗 这应该在[TGA或TAG或TAA]中断。 ...2024-04-20 已阅读: n次
为序列中某些出现之间的值创建列表。Python我发布了一个关于阅读框架的后续问题。你知道吗 sequence = 'AAATGAAATAAGGATGGGGTAGTATGATGTGTTT' 我最终要寻找一个特定的模式“ATG”,我想扫描输入序列, ...2024-04-20 已阅读: n次
更新数据帧中的单元格会改变整行吗?我的数据框架由DNA序列组成,每列包含3个碱基,代表密码子。我的目标是在给定的条件下,将任何包含某个字符串的密码子更新为间隙。示例条件,如果我的密码子列表中的任何终止密码子出现在小于某个百分比的列中, ...2024-04-20 已阅读: n次
DNA到蛋白质序列用户可使用程序输入3个氨基酸序列来创建氨基酸序列: {'TGA': '*', 'GCG': 'A', 'CGA': 'R', 'ATA': 'I', 'AGA': 'R', 'TAA': '*', ' ...2024-04-20 已阅读: n次
将DNA转化为蛋白质我是一名生物学研究生,在过去的几个月里,我自学了非常有限的python来处理一些数据。我不是要求家庭作业帮助,这是一个研究项目。 有了这段代码,我打算从一个名为sequence的字符串中提取一部分,介 ...2024-04-20 已阅读: n次
从列表的元素Python生成元组对这是一个很简单的问题,但从昨晚开始我就想不出怎么做了。 假设我有一个清单: L = ['AAG', 'AGA', 'GAT', 'ATT', 'TTC', 'TCT', 'CTC', 'TCT', ' ...2024-04-20 已阅读: n次