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关于emcee 相关联的Python项目和问题：

为什么回火mcmc配合不好？

我尝试使用parallel-tempered mcmc将简单的直线y=mx+c类型与一些合成数据相匹配。我的目标是能够理解如何使用它，以便以后可以应用于一些更复杂的模型。我尝试的例子是一个简单的主持人 ...

2024-05-02 已阅读: n次

pymc3中的多元线性回归

我最近开始学习pymc3，之前我专门使用了emcee，我遇到了一些概念上的问题。在我正在练习Hogg's Fitting a model to data的第7章。这涉及到一个具有任意二维不确定性的直 ...

2024-05-02 已阅读: n次

为什么主持人.集合采样器.run\u mcmc（）功能不变主持人.合奏采样器.chain我的任何步行者的连续步骤的值？

我在管理主持人函数在emcee库中生成参数的马尔可夫链，用于我正在做的一些研究。出于某种原因，run\u mcmc函数运行时，我在主持人.合奏采样器.chain当它们本质上应该是近似高斯分布时，对象一 ...

2024-05-02 已阅读: n次

为每个并行进程创建一个池

我正在编写一个代码，它迭代地适合由ncomp组件组成的模型。每个组件都与emcee匹配。我希望并行地安装组件，并且我也希望并行化emcee。其思想是每个进程为emcee创建自己的池。最好的方法是什么？ ...

2024-05-02 已阅读: n次

多线程Windows无法运行

我在Windows桌面上以多线程模式运行python Emcee mcmcc代码时遇到问题。它用一个线程运行良好，在我的macosx笔记本电脑上以单线程或多线程模式运行。下面是一个简单的示例代码（取自 ...

2024-05-02 已阅读: n次

在Python中传递返回NaN的函数的输入

我正在使用EMCEE。我写了一个部分，从那里提出的问题在下面。我遇到了这个错误 ValueError: lnprob returned NaN. 这个错误中断了计算，我不知道如何克服。所以，我应该做 ...

2024-05-02 已阅读: n次

ValueError:使用emcee软件包时概率函数返回NaN

我使用emcee软件包来确定应遵循泊松分布的测量数据集的最佳参数。我使用的代码是 def lnL_Poisson(theta,x,y,yerr): logA,beta = theta ...

2024-05-02 已阅读: n次

在类内使用emcee库中的多处理

我曾尝试使用emcee库在类中实现蒙特卡罗马尔可夫链，并使多处理模块正常工作，但在运行了这样一个测试代码之后： import numpy as np import emcee import scipy ...

2024-05-02 已阅读: n次

virtualenvwrapper安装的Jupyter笔记本使用virtualenv python，但使用全局pip&packages

我有一个虚拟说唱歌手包装的虚拟。我们称之为测试。Jupyter是通过我的全局pip和virtualenv的pip安装的。你知道吗 $ which python /usr/bin/python $ wh ...

2024-05-02 已阅读: n次

Python3：使用列表理解将字符串转换为变量

在Python 2.7中，我曾经能够使用以下代码（我正在使用emcee包）： def main(): from emcee import moves emcee_moves = ['K ...

2024-05-02 已阅读: n次

主持人如何恰当地平行化黑盒可能性

我目前正在使用emcee包通过教程https://emcee.readthedocs.io/en/stable/tutorials/parallel/获取MCMC样本。串行版本的代码可以工作，但是速度 ...

2024-05-02 已阅读: n次

重试直至没有运行时警告

我试着用MCMC来拟合曲线。在由于我的特殊问题的性质，偶尔（运行代码的1/5次）会遇到一些奇点，代码会向我发出运行时警告并继续给出错误的答案。在 /Library/Python/2.7/site-p ...

2024-05-02 已阅读: n次

emcee

仿射不变mcmc的python集成采样工具包 emcee是一个稳定的、经过良好测试的python仿射不变量的实现。马尔可夫链蒙特卡罗（MCMC）的集成采样器提出的 Goodman &a ...

2024-05-02 已阅读: n次

ptemcee

ptemcee/'t_msi_/（名词）： Adaptive parallel tempering遇到emcee。 ptemcee，发音为“tem cee”，是daniel foreman ...

2024-05-02 已阅读: n次

naima

naima是一个python包，用于计算相对论粒子布居。它包括执行MCMC装配的工具利用emcee的x射线、gev和tev谱辐射模型连锁蒙特卡洛。 naima以相册中出现的ballad comp ...

2024-05-02 已阅读: n次

uhammer

uhammer为emcee提供了一个便利层。功能：uhammer 提供简化的API。在多核上运行或使用mpi运行之间不需要代码更改。修复了emcee/schwimmbad中mpi池的一些问题。 ...

2024-05-02 已阅读: n次