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Python motifs
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关于motifs 相关联的Python项目和问题：
最新问答
我有一份格式如下的文件
QUERY: STBZIP38
Length of Query Sequence: 2000 bp | Nucleotide Freque ...
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我正在将一个JSON从Python后端传递到我的前端JavaScript中，在那里我运行一个webGL（three.js）动画。JSON保存决定动画中发生什么的数值。我的问题是，当我有一个基本的aja ...
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我在一个生物信息学项目中遇到了一些编码问题。基本上，我的任务是从数据库中提取motif序列，并使用这些信息来注释序列对齐文件。对齐文件是纯文本，因此注释不会很复杂，最多只是将提取的序列替换为对齐文件本 ...
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我正在查一个文件。如果这行以“SegID”开头，我想看它后面的第21行，如果这行以“细胞质”以外的任何东西开头，我想把以SegID开头的行和以“细胞质”以外的任何东西开头的行写入一个文件。你知道吗
到 ...
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当我试图运行一个pytorch更快的rcnn代码时（从https://github.com/rowanz/neural-motifs），我得到如下问题
THCudaCheck FAIL file=/o ...
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xml文件如下所示：
<?xml version="1.0" ?>
<?xml-stylesheet type="text/xsl" href="Cistrome.xsl"?> ...
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看看代码。当genmotif的参数设置为n_seq=5000和n_pos=10时，并行版本getPairedSeqNames3和getPairedSeqNames1要慢得多。但当n_seq=50且n_ ...
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我已经建立了一个由我所拥有的酶序列组成的系统进化树。我有一个简单的格式，只有分数显示，没有颜色。现在我得到的序列是限制性酶，每个都有一个motif。我想给有相似motifs的酶分支着色。昨天的大部分时 ...
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向stackoverflow社区致意
我目前正在攻读生物信息学模块，作为生物医学学位的一部分（我基本上是一个python新手），以下任务是python编程任务的一部分：
提取motif序列（氨基酸序列 ...
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问题陈述
我正在使用python3并试图编写一个IntervalTrees字典，它的重量大约为2到3gb。这是我的控制台输出：
10:39:25 - project: INFO - Checking ...
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我在用Biopython处理一些数据。
但是当我在Biopython中使用motif模块时遇到了一个奇怪的问题。
这是密码。你知道吗
frame = pd.DataFrame({'Spacer': s ...
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在snakemake中，对于给定的规则，拥有资源使用永久性的最佳方法是什么？这意味着给定规则的resources继承以下规则。一个例子是在分区（例如/dev/shm）中一次限制一个输入bam文件，而随 ...
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最新项目
简介
做一些简要介绍
包装信息
文档的最新版本，包括安装、使用和
api/developer注释可以在
ReadTheDocs。
源的最新版本可以在
GitHub。请使用
Gith ...
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netsci
用python分析复杂网络
Author
Version
Demo
Gialdetti
netsci是一个python包，用于对空间嵌入式网络进行有效的统计分析。此外 ...
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motif守恒分析工具moca
许可证
ISC
安装
要求
pybedtools
生物圈
熊猫
scipy
统计模型
侏儒
肖伯恩
模因=4.10.2
注：moca还依赖于m ...
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