将hmmer tblout输出转换为数据帧 有没有办法将hmmer输出转换为数据帧 我还不确定如何通过将hmmer tblout表加载到python中 生物模块 我相信您可以使用SeqIO.parse或SeqIO.search调用hmmer ...2024-04-27 已阅读: n次
如何向用作python字典键的字符串追加字符(当有多个条目与该字符串相关时)?我从HMMER生成的输出文件中提取序列坐标(在基因组汇编文件中查找DNA序列,匹配查询)。在 我创建了一个python字典,其中键是源序列名(一个字符串),值是一个包含目标序列开始和结束坐标的列表。然 ...2024-04-27 已阅读: n次
在python中运行的多进程命令的最佳资源分配我开发了一个工具,要求用户提供运行它所需的CPU数量。你知道吗 作为程序的一部分,该工具调用HMMER(HMMER-http://eddylab.org/software/hmmer3/3.1b2/U ...2024-04-27 已阅读: n次
deepbgcdeepbgc:生物合成基因簇检测与分类 deepbgc利用深度学习检测细菌和真菌基因组中的bgc。 deepbgc采用双向长短期记忆递归神经网络 以及一种类似于word2vec的pfam蛋白结构域载 ...2024-04-27 已阅读: n次