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Python allele
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最新问答
我编写了一个脚本,可以读取包含多行数据的文本文件。数据行示例:
10 1100 1101 G G G G G G ...
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我有一个看起来像
|-- alleleFrequencies: array (nullable = true)
| |-- element: double (containsNull = t ...
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这是我的密码。如果我打印变量,效果很好,但是如果我返回变量并尝试在其他地方打印它们,则只打印最后一个元素。你知道吗
def train_data(fname):
#load csv trai ...
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d = enchant.Dict('en_us')
d.check( ...
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我想把我的第N个碱基对还给我fna.gz公司基因组输入。理论上它是这样工作的:
allele = genome[14325]
print(allele)
#: G
这是我现在掌握的代码:
^{pr2 ...
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我有一个6列的CSV文件。我将它加载到内存中,并通过一些方法进行处理。我的结果是一个包含4列的数据帧,如下所示:
name number Allele Allele
aaa 111 A ...
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我有一个数据帧,它包含一个主要是NaN的,但某些条目中也有字典。我的目标是将这些字典扩展到数据帧的列,并将它们的条目保留在各自的索引中。
这就是数据帧的一小部分。在
...
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我实现了下面的类,根据输入频率“p”生成“p”或“q”。但是,如果频率小于用于存储选项的列表的大小,则此实现将中断。有没有一种方法,我可以实现它,对p的任何值起作用?在
from random imp ...
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从json API提取数据时遇到问题。我想得到“总等位基因计数”。我可以从API中提取其他数据,但是当涉及到“exac”数据时,它就不起作用了。你知道吗
"alterations" : [
...
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我有一份清单:
sample = [['TTTT', 'CCCZ'], ['ATTA', 'CZZC']]
count = [[4,3],[4,2]]
correctionfactor = [[1. ...
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我想做的是估计每个肽的得分,即行
我的代码如下:
import csv, math
def train_data(fname):
#load csv training files
...
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我试图通过putty在远程服务器上运行python代码来生成一个图形。你知道吗
我试过使用:
plt.scatter(df['Allele Frequency'], df['Effect Siz ...
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最新项目
皮亚德
用python实现hla的ard reduction
自由软件:lgpl 3.0
文档:https://pyard.readthedocs.io。
安装
# from source ...
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核糖体rna等位基因树
此包Python名称:rrat
目前版本: rrat 0.6
最后维护时间:Mar 29, 2018
...
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