使用subprocess.run()在python中运行samtools时出现问题我正在使用subprocesss.run()在python中运行samtools命令。代码如下: result = subprocess.run(['samtools', 'faidx', 'hg38 ...2024-04-20 已阅读: n次
将python中由换行符分隔的字符串文件解析为json数组我有一个名为path_text.txt的文件,其内容是由换行符分隔的两个字符串: /gp/oi/eu/gatk/inputs/NA12878_24RG_med.hg38.bam /gp/oi/eu/ ...2024-04-20 已阅读: n次
基于另一个fi筛选txt(GTF)文件 有人能帮我解决一个AWK问题吗? 我有一个大的GTF文件如下。第9个字段包含我要使用的gene iu id。在 文件1.gtf chr1 hg38_refGene exon 67 ...2024-04-20 已阅读: n次
如果文件1中的第9列小于文件2中的第4列,如何打印文件1和文件2中的行我需要帮助。我试着没有用。 如果file1的column2与file2的column1相同,那么$9 file1>;=$4文件2&&$10文件1<;=$五, 文件1 BG ...2024-04-20 已阅读: n次
genomep#基因拷贝[![Bioconda徽章](https://img.shields.io/badge/install%20with-bioconda-brightgreen.svg?style=flat) ...2024-04-20 已阅读: n次
ga4gh-dos-schemas数据对象服务(DOS)API的模式 View the schemas in Swagger UI < DOS的目标是在现有对象存储系统之上创建通用API。 因此,工作流系统可以以一种单一的、 ...2024-04-20 已阅读: n次
ntaiNTAI NTAI代表核苷酸(NT)人工智能(A.I.)。NTAI是一个小的 用于将fasta序列与人工智能(a.i.)结合使用的python库。 目前有两个主要模块将被使用 Codex,和 bed ...2024-04-20 已阅读: n次
bgsignaturebgsignature是用于计算签名的包。 最基本的计算类型是计算 不同k-mer的计数(如3或5)。 这个计算可以对一组突变进行, 一组区域或一组突变 属于某些地区。 bgSignature由3个工 ...2024-04-20 已阅读: n次
annot-utils不能使用 简介 annot_utils是一个生成tabix索引注释文件的软件,可以由y.s共享。 目前,该软件只支持hg19(grch37)、hg38(grch38)和mm10(grcm38)的 ...2024-04-20 已阅读: n次
cmsipCMSIP 从CMS-IP测序数据中检测不同的5HMC区域。 源URL:https://github.com/lijinbio/cmsip 安装 依赖性 bsmap bsmap是moabs包中的一 ...2024-04-20 已阅读: n次