如何使用其他列按条件按行提取数据帧值?我有一个数据框,如下所示: #values a=["003C", "003P1", "003P1", "003P1", "004C", "004P1", "004P2", "003C", "003P2 ...2024-04-25 已阅读: n次
用a+B列中的字符替换[C]中的字符的最佳方法是什么我用熊猫和我得到堆栈在下面的任务。你知道吗 我有下表: CHROM POS SNP chr1 931131 ? chr1 959265 ? chr1 970922 ...2024-04-25 已阅读: n次
如何在Pandas数据框中按名称选择行列表?我正在尝试使用列表从Pandas数据帧中提取行,但无法完成。下面是一个例子 # df alleles chrom pos strand assembly# center protLS ...2024-04-25 已阅读: n次
通过python(Py2neo)将大型数据集转录到Neo4j中在过去的几周里,我一直在尝试使用Scikit Allel库将基因组数据集加载到Neo4j中。我已经设法在VCF文件中加载外显子的所有变体以及所有具有相关表型数据的受试者,现在我正试图创建变体和受试者之 ...2024-04-25 已阅读: n次
是否有一种“Pandas”方法来标识合并结果中不存在数据帧中的哪些行?我有两个大数据块,两个公共列将它们连接在一起。一个“应该”是另一个的子集,但是当我执行合并时,最终的结果比子集小,所以我想查看原始行(以及子集中的行)中的行,以了解为什么不能正确合并。这可能是上游脚本 ...2024-04-25 已阅读: n次
应用操作中的pandas groupby添加列给定这样的数据帧 chrom first_bp_intron last_bp_intron unique_junction_reads chr1 100 200 10 chr1 10 ...2024-04-25 已阅读: n次
pandas groupby正在返回两个具有相同唯一id的组我有一个大熊猫数据框,在这里我运行的操作组。你知道吗 CHROM POS Data01 Data02 ...... 1 .................... 1 ...2024-04-25 已阅读: n次
如何跨行获取特定字符串的计数?我的数据框架如下: 我想将数据帧的新列中的D、T和N的计数作为Dcount TCount Ncount data = {'CHROM':['chr1', 'chr2', 'chr1', 'chr3', ...2024-04-25 已阅读: n次
带变量的python中的浮点除法错误所以我做了一件非常简单的事情: shared = sum*2.0/(totalCNV(CNVs1,str(chrom))+totalCNV(CNVs2,str(chrom))) 我明白了: ^{pr ...2024-04-25 已阅读: n次
如何设置seaborn barp的宽度我想根据列chrom具有特定值的次数来设置条形图上每个条形图的宽度。 我将宽度条设置为事件列表: list_counts = plot_data.groupby('chrom')['gene'].c ...2024-04-25 已阅读: n次
在大型txt文件中查找头文件假设我有一个有几百万行的大文件。前300+(可变编号)行包含有关文件的信息,然后在数据前面有一个标题行。我不知道标题在哪一行,但我知道它的开头是什么。以下是我的数据示例: #This File con ...2024-04-25 已阅读: n次
gym-chrome-dino#Gym Chrome Dino一个用于Chrome Dino/T-Rex Runner游戏的OpenAI Gym环境此环境利用了Chrome Dino的[分叉版本](https://github.c ...2024-04-25 已阅读: n次
vcfsyncervcfsyncer:同步多个vcf的包 这是一种透明地使用单样本VCF的方法,就好像它们是 多样本VCF。 安装 安装vcfsyncer最简单的方法是通过pip: pip install vcfsyn ...2024-04-25 已阅读: n次
itree ITree itree是基于自平衡avl二叉搜索树的区间树数据结构。 适用于生物信息学中的序列特征。 为什么itree? itree速度快 itree实现了一个扩展的搜索树optimized ...2024-04-25 已阅读: n次
liftoverpython liftover实用程序 转换基因组集合之间的点坐标。 灵感来自pyliftover,初选 它提供的优点是字典式转换,如在access-converted中 通过converter[ch ...2024-04-25 已阅读: n次