zarr不考虑来自xarray的块大小并恢复到原始块大小我正在打开一个zarr文件,然后重新缓存它,然后将它写回另一个zarr存储。然而,当我打开它的时候,它并不尊重我之前写的块大小。以下是jupyter的代码和输出。知道我做错了什么吗 bathy_ds ...2024-05-19 已阅读: n次
使用Zarr存储Dask阵列会消耗太多内存我有一个很长的.zarr数组列表,我希望将其合并到单个数组中并写入磁盘 我的代码大致如下所示: import dask.array import zarr import os local_paths ...2024-05-19 已阅读: n次
如果是并发读/写访问,会发生什么?在zarr tutorial中写着: Zarr arrays have not been designed for situations where multiple readers and w ...2024-05-19 已阅读: n次
获取zarr数组切片的视图我想生成一个指向磁盘上zarr数组部分的zarr数组,类似于sliced = np_arr[5]给我一个np_arr视图,这样修改sliced中的数据就会修改np_arr中的数据。示例代码: impo ...2024-05-19 已阅读: n次
将.h5(HDF5)文件转换为.zarr格式时,我遇到一个类型错误我正在尝试将.h5文件转换为.zarr格式,但出现以下错误 TypeError: Object of type bytes_ is not JSON serializable 我把我的密码贴在下面 ...2024-05-19 已阅读: n次
使用pytorch dataloader的开始和结束在zarr阵列上创建生成器我正在做一个pytorch项目,我的数据保存在zarr 对zarr的随机访问成本很高,但由于zarr使用了分块缓存,迭代速度非常快。为了利用这一事实,我将IterableDataset与多个worke ...2024-05-19 已阅读: n次
用kd树搜索相邻点我有三个numpy数组中包含的一组坐标:xarr,yarr和{}(每个数组中的对应位置属于同一个点,即第一个点在xarr[0],yarr[0],zarr[0])。如果在P(x,y,z)处有另一个点,我 ...2024-05-19 已阅读: n次
xarray.Dataset.to_zarr:用于“附加到现有zarr存储”的文档?在对xarray.Dataset.to_zarr的region参数的描述中,最后一句陈述:See “Appending to existing Zarr stores” in the referenc ...2024-05-19 已阅读: n次
为什么使用dask时,zarr的性能比拼花地板好得多?当我使用dask对zarr数据和拼花地板数据进行基本相同的计算时,基于zarr的计算速度要快得多。为什么?是不是因为我在创建拼花地板文件时出错了 我在jupyter笔记本上用假数据(见下文)复制了这个 ...2024-05-19 已阅读: n次
如何在追加期间写锁zarr存储?在使用append时,是否有某种方法可以锁定zarr存储 我已经艰难地发现,将append与多个进程一起使用是一个坏主意(要追加的批与存储的批大小不一致)。我希望使用多个进程的原因是,我需要在将原始数 ...2024-05-19 已阅读: n次
未知形状的Dask阵列到zarr我试图在zarr文件中存储dask数组。在 当dask数组有一个定义的形状时,我已经成功地做到了。在 import dask import dask.array as da import numpy ...2024-05-19 已阅读: n次
指定数量的numpy数组有多少个元素对于长度不等的排序的numpy数组的列表(例如M0,M1,M2),我想找出这些数组中每个数组的多少元素在数组的相邻对(例如zbin)给出的数字范围内。zbin未排序,所述数字范围如下[z[0], z[ ...2024-05-19 已阅读: n次
zappzappy-使用numpy和zarr进行分布式处理 zappy用于在诸如Pywren、apache spark和apache beam之类的引擎上对大块numpy数组进行分布式处理。 zapp ...2024-05-19 已阅读: n次