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关于mus 相关联的Python项目和问题：

用python解析文本中的id

我有这段文字： >gi|124486857|ref|NP_001074751.1| inhibitor of Bruton tyrosine kinase [Mus musculus] > ...

2024-04-26 已阅读: n次

Python：包中的一些东西是可见的，其他的是n

包结构： World\ __init__.py Chip\ __init__.py grass.py snow.py w ...

2024-04-26 已阅读: n次

Biopython（或一般的Python）：使用gi identifi从一个大的.fasta文件中解析物种名称的最有效方法

我有一个.fasta文件（.txt基本上）大约145000个条目，格式如下 >gi|393182|gb|AAA40101.1| cytokine [Mus musculus] MDAKVVAVL ...

2024-04-26 已阅读: n次

如何找到两个特殊字符之间的字符串？

例如，我需要两个方括号之间的所有内容。文件1 [Home sapiens] [Mus musculus 1] [virus 1 [isolated from china]] 所以考虑到上面的例子， ...

2024-04-26 已阅读: n次

如何使用cvxopt进行带约束的均值-方差优化？

我可以使用cvxopt根据文档计算有效边界： http://cvxopt.org/examples/book/portfolio.html 但是，我不知道如何添加一个约束，以便在特定资产的最大允许权重 ...

2024-04-26 已阅读: n次

高斯混合的密度估计与密度P不同

我有一个数据集x，它是由四种不同的高斯函数混合而成的： mus = [60,150,300,500] sigmas = [5,10,10,50] Ns = [380,670,440,810] Ns_r ...

2024-04-26 已阅读: n次

列出Python中包含部分字符串的文件名

我试图列出一个目录中包含我指定的字符串的所有文件。我想随着循环的每次迭代改变这个字符串。我使用的代码是： from subprocess import Popen from subprocess im ...

2024-04-26 已阅读: n次

根据文件名列表打印目录中文件的某些行

我试图打印基于正则表达式的目录中许多文件的特定行。我有一个文件名列表和一个包含这些文件的目录。我只知道如何打印目录中所有文件的行。但我只需要打印filename.txt列表中文件的行 for f in ...

2024-04-26 已阅读: n次

使用cd开始使用cython

我不知道如何用cython设置和运行代码。在我在代码的相关部分添加了cdef、double等。在在设置.py当然没有人用“你好”这个名字。 cython doc from distutils.co ...

2024-04-26 已阅读: n次

对于2Gb文本fi，搁置字典大小>100Gb

我正在从基因组FASTA文件中创建一个序列的搁置文件： # Import necessary libraries import shelve from Bio import SeqIO # Crea ...

2024-04-26 已阅读: n次

从utra序列中提取RNA

我试图从数据库中检索特定的RNA UTR序列。从数据库中，我得到了一个.dat文件，其中每个RNA UTR都由如下条目表示： ID 5MMUR018955; SV 1; linear; mRN ...

2024-04-26 已阅读: n次

比较数据帧中的两个Pandas系列，并在该系列上应用说明

我一直在尝试比较熊猫数据帧中两个系列的子字符串。这两个系列分别是“标题”和“新闻”，这两个系列分别是我从一家报纸网站上抄来的新闻标题和新闻正文。现在，许多“新闻”索引的第一行都包含了标题，我想从“新闻 ...

2024-04-26 已阅读: n次

Lyrics

搜索音乐歌词的库。安装： lyricspy可以使用来自pypi或github的pip安装使用pip通过pypi: pip install -U lyricspy 使用pip+git通过git ...

2024-04-26 已阅读: n次

museval

博物馆一个python包，用于使用musdb18数据集评估源代码分离结果。该软件包是信号分离评估活动（SISEC）的MUS任务的一部分。 bsseval v4 BSSEVAL指标，正如在Mat ...

2024-04-26 已阅读: n次

mus

mus-轻质分布式测井此包Python名称：mus 目前版本： mus 0.0.6 最后维护时间：Oct 15, 2015 ...

2024-04-26 已阅读: n次

musdb

musdb 一个python包，用于解析和处理musdb18数据集，这是用于音乐源分离的最大开放访问数据集。该工具最初是为音乐分离任务开发的，作为信号分离评估活动（SISEC）的一部分。获取 ...

2024-04-26 已阅读: n次

scikits.bvp1lg

python为odes的边值问题包装了遗留解算器。这些是通过包装colnew和mus fortran实现的来自netlib.org的代码。 ...

2024-04-26 已阅读: n次

phoenix

菲尼克斯模拟器3的小部件接口此包Python名称：phoenix 目前版本： phoenix 0.9.1 最后维护时间：Apr 3 ...

2024-04-26 已阅读: n次

agfusion

注释基因融合（agfusion） agfusion是一个python包，用于注释来自人类或小鼠基因组的基因融合。agfusion只需要参考基因组、两个基因伙伴和融合连接坐标作为输入，并输出以下信息： ...

2024-04-26 已阅读: n次