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Python htslib
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最新问答
我一直在尝试在anaconda3环境中安装一些python包。但是我得到了这样一个错误:
checking for lzma.h... yes
checking for lzma_easy_ ...
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我一直未能在macOS High Sierra上安装pysam 0.13。
总结一下我的两个错误:
htslib/htslib/hts.h:142:9: error: missing ',' betw ...
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我试图在Python3.4上安装pysam和pybedtools模块。但我有个错误:
Collecting pysam
Using cached pysam-0.9.0.tar.gz
Co ...
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cyvcf2
如果您使用cyvcf2,请引用paper
快速python(2和3)分析vcf和bcf,包括区域查询。
cyvcf2是围绕htslib构建的cython包装器,用于快速解析Varia ...
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#解析
##概述
##安装
依赖关系:
bam解析是使用c和一些外部库完成的。您至少需要:
gcc
libcfu
htslib
安装htslib的注意事项:
出于各种原因,我们需要安装一个静态链接的 ...
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pysam-一个用于读取、操作和编写的python模块
基因组数据集。
pysam是htslib c-api的轻量级包装器,它提供
读写SAM/BAM/VCF/BCF/BED/GFF/GTF/FAST ...
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#巴姆比
支持bam、sam和bgzf压缩的htslib的python实现 ...
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