Python sge_专题 - Python中文网

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关于sge 相关联的Python项目和问题：

Sun Grid引擎上的ipcluster只有0级

我设置了一个IPython parallelipcluster来使用Sun Grid引擎，一切看起来都很好： ipcluster start -n 100 --profile=sge 2016-07- ...

2024-04-30 已阅读: n次

访问从SunGridEngin创建的python文件

我有一个python脚本，它向SGE（sungrid引擎）提交一个作业。作业完成后，我想访问从SGE作业生成的输出文件。我看到目录中的“ls”表示文件已经存在，并且工作已经完成，但是python需 ...

2024-04-30 已阅读: n次

捕捉Python异常并打印出单独的消息

我目前正在尝试编写代码来捕捉异常，根据抛出的异常，将导入一个与没有异常时不同的模块。在 try: import sge_execution_engine as execution_engine e ...

2024-04-30 已阅读: n次

对嵌套列表中的元素进行计数

我有一个嵌套列表，比如 lst = [(123, 'bbb', 'bcd'), (245, 'brb', 'gsh'), (832, 'sge', 'hsw'), (832, 'sge ...

2024-04-30 已阅读: n次

Python脚本、conda和clus的SnakeMake规则

我想让snakemake通过SGE集群在特定conda环境下运行Python脚本。在在集群上，我在主目录中安装了miniconda。我的主目录是通过NFS挂载的，因此所有集群节点都可以访问。在因为 ...

2024-04-30 已阅读: n次

等待作业完成的有效方法：python和drm

我想问一下我通过Python使用的drmaaapi中的“等待”特性。它是否执行常量qstat（如果我们在SGE上运行它）来检查程序是否已完成执行。在我们的管理员希望我们避免任何恒定的qstat，因为 ...

2024-04-30 已阅读: n次

SGE clus上的Java最大堆大小

我有一个用python编写的管道，用Java调用一些进程。管道以两种可能的模式运行：本地模式（在单个节点上）或在SGE集群上。在当我将选项设置为cluster mode时，日志中的错误消息如下所示 ...

2024-04-30 已阅读: n次

在SnakeMake中使用Conda环境解决SGE集群问题

相关：SnakeMake rule with Python script, conda and cluster 我一直在尝试将我的SnakeMake管道设置为在SGE集群（qsub）上运行。使用直接安 ...

2024-04-30 已阅读: n次

使用Python向QSUB提交带有数值参数的作业

我想用SGE（QSUB）在集群的不同节点上运行一个python函数，比如my_fun(x1,x2)。我创建了一个脚本my_script.py，它接受来自命令行的数值参数，因此在本地运行时，我将其称为 ...

2024-04-30 已阅读: n次

SGE DRMAA python作业过程

我正在使用pythondrmaa库在SGE集群上启动作业。我的服务在restapi上可用，在我的测试期间，一切正常，作业被提交/等待完成/完成后检索结果。进程在同一个drmaa会话中运行一次。在在我 ...

2024-04-30 已阅读: n次

如何使用Python并行模块多处理.池在Sun SGE网格上

我有一段python代码，它在一台机器上运行multiprocessing.Pool，用于许多独立的作业。我想知道在SGE网格上是否有可能使其更加并行，例如，网格的每个节点都为这些独立的作业运行多个线 ...

2024-04-30 已阅读: n次

并行SGE队列不执行python cod

我目前正在使用一个使用SGE的群集。在这里，我通过调用qsub run.sh向并行队列提交一个.sh脚本，该脚本调用python脚本（使用multiprocessing.pool进行多线程处理）。py ...

2024-04-30 已阅读: n次

jobsubmitter

#作业提交者[！[条件]（https://img.shields.io/conda/dn/ostrokach/jobsubmitter.svg）]（https://anaconda.org/ostro ...

2024-04-30 已阅读: n次

gridmap

一个包，允许您直接从 Python您可以直接将python函数映射到集群上，而无需自己编写任何包装器代码。这是名为Python Grid的旧项目的ets分叉。不像年长的版本，与Pyth ...

2024-04-30 已阅读: n次

sjs

这个包包含一个sge模拟器，包括模拟qsub、qdel和qstat的脚本。这个软件包是为支持在不支持sge的机器上开发依赖sge的软件而编写的，因此功能集和优化在设计上是非常有限的。我不建议将此用作 ...

2024-04-30 已阅读: n次

dask-drmaa

在运行 DRMAA兼容的作业计划程序。示例从python启动 from dask_drmaa import DRMAACluster cluster = DRMAACluster() fro ...

2024-04-30 已阅读: n次

pythongrid

pythongrid概述主要开发地点：http://code.google.com/p/pythongrid/ 主持人：Chris Widmer，Cheng Soon Ong 该模块使用sun网格引 ...

2024-04-30 已阅读: n次

sgeparse

用于分析sge qstat输出的简单python模块。只有一个顶级函数：get_jobs，它返回当前排队（运行或等待）作业的字典列表。要求唯一的需求是python 2.7+或3.3+。所有代码都 ...

2024-04-30 已阅读: n次

drmaa

Distributed Resource Management Application API （drmaa）python的绑定。了解更多信息 read the docs。如果只想在drm ...

2024-04-30 已阅读: n次

pypez

概述一个简单的模块，用于指定和执行一系列的命令，最多有一级分支（其中几个任务并行执行）继续执行一行。功能执行一系列命令行，允许一些步骤并行运行，然后再按顺序继续。将命令标准输出保存到 ...

2024-04-30 已阅读: n次

dask-jobqueue

易于部署DASK分布式作业排队系统，如PBS、SLURM，或者中士。有关详细信息，请参见documentation。许可证新的疯牛病见License File。 ...

2024-04-30 已阅读: n次

gridtk

并行作业管理器这个包是信号处理和机器学习工具箱的一部分 Bob它为sge实用程序提供了一组python包装器，比如qsub， qstat和qdel。它与这些工具交互以提交和管理网格构 ...

2024-04-30 已阅读: n次

qtask

用于向群集提交作业的实用程序库（SGE、PBS等）此包Python名称：qtask 目前版本： qtask 0.1.3 最后维护时 ...

2024-04-30 已阅读: n次

atsge

ATSGE AlphaTwirl工具，用于将作业提交给SGE批处理（英制） ...

2024-04-30 已阅读: n次

pysge

pysge + + /\ /\ \ O \ / \\ /\ /\\\ \_/|\_\ / \\/ ...

2024-04-30 已阅读: n次

sgejob

sgejob 1简介和达蒙一起收集SGE的工作信息。见https://github.com/linzhi2013/sgejob 2安装确保您的pip来自python3 $ pip install ...

2024-04-30 已阅读: n次

zdb-analysis

z不可见数据库分析使用设置 source setup.sh 要运行分析，请使用zdb_analyse.py： usage: zdb_analyse.py [-h] [-m MODE] [-j NC ...

2024-04-30 已阅读: n次

remote-sge

#远程SGE：远程将作业提交到GridEngine*远程将作业提交到GridEngine群集。*检索作业结果。*自动将作业从一个群集传输到另一个群集。从群集的主主机以外的计算机向SGE提交作业。*[请 ...

2024-04-30 已阅读: n次

submitter

简单的SGE工作提交者。此包Python名称：submitter 目前版本： submitter 0.4 最后维护时间：Dec 6 ...

2024-04-30 已阅读: n次

qbatch

在slurm、s（sun on of）网格引擎（sge）和pbs/torque集群上并行执行shell命令行此包Python名称：qbatch 目 ...

2024-04-30 已阅读: n次

batchcompute-sge

阿里云BatchCompute SGE命令行界面此包Python名称：batchcompute-sge 目前版本： batchcompute-sg ...

2024-04-30 已阅读: n次