读入大表文件,但使用pandas只保留一小部分行我有一个大的表文件(大约2GB),它包含一个距离矩阵,该矩阵由它的第一列索引。它的行看起来像 A 0 1.2 1.3 ... B 1.2 0 3.5 ... C 1.5 0 4.5 ... 但是,我 ...2024-03-29 已阅读: n次
如何使用正则表达式选择文件路径的单个部分我有这样一个文件路径: "C:/Users/myname/Documents/KF0_IFN_HLA_11.csv" 如何使用正则表达式来获取"KF0_IFN_HLA_11.csv"部分?你知道吗 ...2024-03-29 已阅读: n次
将信息从dict传递到snakemake会导致缺少输入文件错误我正在使用csv文件读取输入信息。使用所需/选定的输入参数创建dict,并将其传递给shell脚本。我收到丢失的inputfile错误,如下所示: Building DAG of jobs... Mi ...2024-03-29 已阅读: n次
Pandas idxmin axis1 返回错误的列名值熊猫的价值: Index Bra Obr Zal Uto Str Nah Tec Ryc Hla BestP_A BestP_Amin BestP_minA 0 461 38 44 ...2024-03-29 已阅读: n次
在python中过滤CSV文件我下载了这个csv file,它创建了一个基因信息的电子表格。重要的是,在HLA-*列中,有基因信息。如果基因的分辨率太低,例如DQB1*03,那么该行应该被删除。如果数据的分辨率太高,例如DQB1* ...2024-03-29 已阅读: n次
budbud==作者:peter hoffmannoverview--安装contribution----示例--loggingbudfile中允许配置:config:包括:-~/bud.ymllog:~/ ...2024-03-29 已阅读: n次
pyard 皮亚德 用python实现hla的ard reduction 自由软件:lgpl 3.0 文档:https://pyard.readthedocs.io。 安装 # from source ...2024-03-29 已阅读: n次
hlaquantHlaquant 作者:Austin Crinklaw 这是什么? hlaquant是一条为hla基因产生快速、准确等位基因特异性表达的管道。这是通过使用具有个性化序列的鲑鱼对肽结合沟域进行量化来完成 ...2024-03-29 已阅读: n次
seqann 用于注释基因功能的python包 自由软件:lgpl 3.0 文档:https://seqann.readthedocs.io。 Jupyter Notebook 概述 seqann包 ...2024-03-29 已阅读: n次
pygfe Pygfe python样板包含创建python包所需的所有样板。 自由软件:lgpl 3.0 文档:https://pygfe.readthedocs.io。 Docker Doc ...2024-03-29 已阅读: n次
transplanttoolbox-victor分子hla分型数据的虚拟交叉匹配 说明 通过交叉引用候选抗原实现实体器官移植的虚拟交叉匹配 供者的hla分型。当供者的hla分型模棱两可而候选者有 等位基因特异性抗体。Victor:分子类型数据的虚 ...2024-03-29 已阅读: n次
hla-genotyper hla基因分型器 hla基因分型器是一个python软件工具,可以直接从bam文件中调用rna-seq和dna-seq中的4位hla基因分型。 ...2024-03-29 已阅读: n次
transplanttoolbox-allan移植工具箱allan:hla分子分型数据到抗原转换的虚拟交叉匹配 说明 用于联合网络器官共享(unos)的器官分配计算机匹配系统 要求移植候选者和供体器官的分子hla分型数据报告为 UNOS抗原进入 ...2024-03-29 已阅读: n次
pyhml Pyhml python hml解析器 自由软件:lgpl 3.0 文档:https://pyhml.readthedocs.io。 Jupyter Notebook 功能 impo ...2024-03-29 已阅读: n次