Python slurm_专题 - Python中文网

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关于slurm 相关联的Python项目和问题：

在HPC上运行并行python程序

我曾经在服务器上使用python进行一些并行计算，现在我想迁移到使用SLURM的HPC上，但我相信我有一些概念上的问题我的计算需要所有运行都相同的矩阵和参数（如字典），以及一些不同的输入参数。所以它 ...

2024-05-17 已阅读: n次

普罗米修斯元数据中不存在公制单位

我在使用Prometheus client module用Python编写exporter时遇到了这个问题。我的一些自定义指标以字节为单位度量内存，因此我在导出器中定义了一个指标： NODES_MEM ...

2024-05-17 已阅读: n次

SLURM srun不并行运行python脚本，但可以访问并行资源

我正在尝试运行一个python脚本，其中部分代码将根据一些SLURM环境变量进行并行化。我不认为确切的代码是重要的，但作为参考，我想use this来训练我的网络现在，问题是我需要通过srun运行我 ...

2024-05-17 已阅读: n次

Python多进程在本地比在群集（slurm）上运行得更快

我有以下代码 import multiprocessing as mp import os def funct(name): if nameisvalid: do_some_ ...

2024-05-17 已阅读: n次

在SLURM中使用sbatch命令时如何导入本地python模块

我在使用集群管理器slurm，并使用sbatch运行提交脚本（使用python interpeter）。sbatch提交导入了我的一个名为main_nn.py的模块。该模块与我的提交目录位于同一位置， ...

2024-05-17 已阅读: n次

使用keras时出现磁盘配额超出错误

我正在尝试使用 model.save_weights('weights.h5') 但这给了我“磁盘配额超出”的错误消息。我从错误消息中猜测它应该占用（由“total write size”表示）小于 ...

2024-05-17 已阅读: n次

keras（tensorflow后端）使用slurm在集群上运行

我有机会在带有slurm workload manager的集群计算机上运行我的Tensorflow培训（集群包含近400000个内核，40000gb的RAM，性能为Rmax=500tflop/s，R ...

2024-05-17 已阅读: n次

如何确保slurm中的python提交脚本位于发出sbatch命令的位置？

我有一个python提交脚本，我使用sbatch运行slurm： sbatch batch.py 当我这样做时，由于我假设，batch.py进程没有继承正确的环境变量，所以不能正常工作。因此，它不是 ...

2024-05-17 已阅读: n次

多节点SLURM纯python解决方案

我正在做一个项目，在SLURM集群上执行多节点python脚本。解决方案应该是p2p，问题是我真的不知道从哪里开始。不过，我应该先广播，对吗？找出哪些节点分配给我的作业（4个节点），然后利用每个节点的 ...

2024-05-17 已阅读: n次

在slurm上使用python的多处理

我试图在slurm上运行一些并行代码，其中不同的进程不需要通信。我天真地使用了python的slurm包。不过，我似乎只在一个节点上使用cpu。例如，如果我有4个节点，每个节点有5个cpu，那么我将 ...

2024-05-17 已阅读: n次

排队clus上Python并行计算

有lots的不同模块用于线程化/并行化python。Dispy和{a3}似乎特别受欢迎。看起来这些都是为一个有很多核心/处理器的单一接口（例如桌面）而设计的。是否有一个模块可以在队列系统运行的大规模并 ...

2024-05-17 已阅读: n次

使用unixslurm时Python内存泄漏

我正在使用slurm在linux服务器上运行一些python代码，在执行之后，slurm发出了一个错误/警告，指出内存过多以及执行过程中可能出现的错误我用16gbram在Windows机器上测试了相 ...

2024-05-17 已阅读: n次

canine

犬科动物基于达尔马提亚的工作经理，使用slurm计划任务用法 Canine通过在一个混乱的集群上运行作业来操作。它的设计目的是为了或使用来自firecloud工作区的数据或使用手动提供的输入 ...

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jobsubmitter

#作业提交者[！[条件]（https://img.shields.io/conda/dn/ostrokach/jobsubmitter.svg）]（https://anaconda.org/ostro ...

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slurm-toys

一组拙劣的命令行工具和包装器，主要在github上找到为什么是泥泞的玩具 slurm toys的目的是打包用python 3或shell编写的有用slurm助手工具，并将它们发布到pypi上的单 ...

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hpc05

HPC05 ipyparallel.Client带有头节点的pbs或slurm集群的包。通过ssh使用headnode连接到pbs或slurm集群的脚本。由于ipyparallel在不活动和人 ...

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slurmlint

一个简单的slurm配置文件linter 目的根据我的经验，在泥浆配置中很容易犯小错误。文件，错误地列出群集中的节点，或未能分配节点到分区，等等。这个包提供了一个简单的命令来检查适合用于自 ...

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jupyterlab-slurm

一种jupyter笔记本服务器扩展，它实现在服务器外壳中执行的常用slurm命令；与jupyterlab slurm jupyterlab扩展结合使用。 ...

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brutius_slurmimus

你呢，畜生？以错误的方式分析slurm信息。这个模块试图复制pyslurm的一些功能，但是而是运行slurm命令（squee，sinfo）并解析它们的输出。它没有跨平台，没有安全，也没有任何东西 ...

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parallelblast

通过分割输入并将作业提交到一个混乱的集群来并行blast搜索。 BLAST作业通过输入截断在一个并行化的slurm队列上运行。而不是像mpiblast那样需要在节点间传递消息的数据库切碎（何时以及是否 ...

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slurm-sbalance

泥浆平衡 sbalance是用于检查帐户余额的slurm实用程序。该实用程序计算帐户中剩余的service units或su。先决条件启用记帐的slurm 目前，sbalance已经用：进行了 ...

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waldur-slurm

用于slurm记帐同步的waldur插件。 ...

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neronet

neronet将是一个框架，旨在与计算集群资源管理器和slurm等作业调度器协作，促进许多不同计算实验的规范、提交、监控、控制、分析和管理。 ...

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SAGA-Hadoop

#Saga Hadoop 上次更新时间：10/01/2016 #概述：使用[saga]（http://saga-project.github.io/saga-python/）在hpc批处理作业中生成 ...

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slurmp

快速脏库，用于通过python2/python3将作业提交给slurm。``python脚本到'scripts/`并自动写入logs/{name}.err和logs/{name}.out。它将在日志和 ...

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myqueue

用于SLURM和PBS的简单前端。文档：https://myqueue.readthedocs.io/ 代码：https://gitlab.com/jensj/myqueue/ ...

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slurmee

泥浆简单的python 3包，用于在slurm中运行python程序时获取信息。用法 import slurmee print(f"Slurm job id: {slurmee.get_job ...

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decimate

namedecimate-容错slurm调度程序扩展]由kaust超级计算实验室（ksl）开发的脚本[参数…]decimate是一个用python编写的slurm扩展，旨在更轻松高效地处理依赖于它的作 ...

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jobwrapper

#作业包装器包装用于启动、监视和通知HPC模拟的管理器命令 ...

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pyslurm

概述目前，pyslurm正在开发中，可以从它上面的薄层移动到面向对象接口的slurm c api。此版本基于Slurm 18.08。先决条件 Slurm Python Cython ...

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sandstone-slurm-assist

完整的文档可以在沙岩泥浆辅助GitHub页面上找到：https://github.com/SandstoneHPC/sandstone-slurm-assist ...

2024-05-17 已阅读: n次

dask-jobqueue

易于部署DASK分布式作业排队系统，如PBS、SLURM，或者中士。有关详细信息，请参见documentation。许可证新的疯牛病见License File。 ...

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