Bash脚本到Conda Install requirements.txt，附带PIP跟踪

Question

在linux服务器上安装Django应用程序的requirements.txt文件时，我可以运行：

conda install --yes --file requirements.txt

如果Conda（PackageNotFoundError）中没有任何包可用，则此操作将崩溃。这个bash one行是一个很酷的方式，一次一行地浏览requirements.txt文件source：

while read requirement; do conda install --yes $requirement; done < requirements.txt

这将安装通过Conda可用的所有软件包，而不会在第一个丢失的软件包上崩溃。但是，我希望通过捕获Conda的输出来跟踪失败的包，如果存在PackageNotFoundError，则在包上运行pip install。

我对bash不太在行，所以希望有人能提出一个建议。另一个解决方案可能是编写一个名为pip-requirements.txt的新文本文件，其中包含失败的需求。

Answer 1

就我个人而言，我觉得水蟒的环境和包装管理非常出色。因此，如果使用conda命令更新python环境中的包，那么我建议使用environment.yml文件，而不是requirements.txt。

environment.yml应该如下所示：

name: root            # default is root
channels:
- defaults
dependencies:         # everything under this, installed by conda
- numpy==1.13.3
- scipy==1.0.0
- pip:                # everything under this, installed by pip
  - Flask==0.12.2
  - gunicorn==19.7.1

要安装的命令：

conda env update --file environment.yml

注：

这里我们设置了name: root，这是默认的anaconda环境名称。这不是如何使用conda和environment.yml文件的标准实践。理想情况下，每个python项目都应该有自己的environment.yml文件，该文件具有特定于项目的环境名称，即name: project-name。请通过https://conda.io/docs/user-guide/tasks/manage-environments.html使用水蟒进行包装管理。

Answer 2

找到解决方案：

如果conda无法使用包，请运行此命令以使用conda或pip安装：

while read requirement; do conda install --yes $requirement || pip install $requirement; done < requirements.txt 

完成后，可以使用conda导出环境yaml：

conda env export > environment.yml

Answer 3

将stderr重定向到文件：

while read requirement; do conda install --yes $requirement; done < requirements.txt 2>error.log