bioconda:没有这样的文件或目录mulledbuild

2024-04-26 10:43:39 发布

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我正在尝试为bioconda构建一个新包(verifybamid)。我在一个最小的Linux虚拟机上运行这个,安装了docker、conda、bioconda utils等。conda build verifybamid有效。当我尝试./simulate-travis.py --packages verifybamid --loglevel=debug时,起初一切正常,但最终我得到了test\u package()调用的No such file or directory: mulled-build。根据bioconda-utils

each built package can now be tested in an isolated busybox container thanks to mulled-build and involucro. This will catch issues where a recipe fails to specify libs (e.g., libgcc) in the run dependencies.

但是我要安装哪个软件包才能让它工作呢?你知道吗

谢谢你, 安德烈亚斯


Tags: todockerinpybuildtravispackagelinux
1条回答
网友
1楼 · 发布于 2024-04-26 10:43:39

你需要安装galaxy lib。实际上,它应该和你的要求.txt文件作为bioconda utils的依赖项。如果没有,请做一个conda install galaxy-lib,您将得到仔细的构建,用Conda包创建非常高效的Docker容器。你知道吗

干杯, 比约恩

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