以自动化的方式获取蛋白质单体

2024-04-16 10:52:19 发布

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对于pdb数据库中给定的一组pdb格式的蛋白质结构,我想找到一些自动化的方法来检查每个结构是否是单体、二聚体、三聚体等,所以我只得到每种情况下的单元结构或单体。我开始研究biopython,但我不确定,也不知道是否有其他方法可以解决这个问题。你知道吗


Tags: 方法数据库格式情况蛋白质结构二聚体pdb
1条回答
网友
1楼 · 发布于 2024-04-16 10:52:19

看起来第一步是访问PDB数据库。我对biopython不太熟悉,但从文档来看,它似乎只内置了以下数据库连接器:

  • 扩展
  • SCOP公司
  • NCBI的Entrez(和Pubmed)

您知道如何连接到PDB数据库吗?你知道吗

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