将同一命令应用于多个子目录中的多个文件

Question

我有一个包含94个子目录的目录，每个子目录包含一个或两个文件*.fastq。我需要对每个文件应用相同的python命令并生成一个新文件qc_*.fastq。你知道吗

我知道如何将bash脚本分别应用于每个文件，但我想知道是否有一种方法可以编写bash脚本，将命令一次应用于所有文件

Answer 1

您可以尝试find . -name "*.fastq" | xargs your_bash_script.sh，它使用find获取所有文件，并将脚本应用于每个文件。你知道吗

Answer 2

使用查找：

find . -type f -iname "*.fastq" -exec python script {} \;

.：最上面的目录

-type f：仅文件

-iname "*.fastq"：文件名以.fastq结尾（不区分大小写）

-exec python script：要执行的命令。你知道吗