在windows for python中安装和使用MAFFTBio.Align.Application应用程序马夫特林

Question

我正在尝试在windows中安装和使用mafft多序列比对算法。我读了mafft文档，它说我要么可以提取mafft win zip文件，要么将其安装在Linux子系统上。我完成了前面的过程，并将路径添加到环境变量设置中。现在我可以从cmd访问mafft，但biopython mafft命令行仍然给我错误，它不能识别mafft。我不认为后面的过程会解决这个问题，因为它不是在windows上，而是在子系统上，也不能从windows中anaconda的jupyter笔记本访问它！ 我在我的ubuntu系统中使用了mafft，它工作得很好，但我需要它在windows上工作，因为我想在windows中运行python代码。如果有人能给我一些提示或方法来解决这个问题，我将不胜感激。你知道吗

Answer 1

粗略猜测，MAFFT可能不在anaconda3箱中，即。~/anaconda3/bin/mafft。你知道吗

它应该工作，即使它是正确可见的系统，但是你可以下载它专门通过康达，即。你知道吗

anaconda-navigator

查看下面的GUI图像，您会看到“Installed”，其中有一个“Installed”的下拉菜单，并检查mafft是否存在。否则只需转到Not installed打开“channels”选项卡并添加bioconda和update，然后更新索引。mafft现在应该出现在下拉菜单“未安装”中。你知道吗

一般信息

如果在远程集群/服务器上加载了anaconda，那么anaconda navigator就可以通过X11远程工作。你知道吗