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如何在Python中查找特定文件
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<p>我有一个目录,其中包含以下结构的文件</p> <pre><code>A2ML1_A8K2U0_MutationOutput.txt A4GALT_Q9NPC4_MutationOutput.txt A4GNT_Q9UNA3_MutationOutput.txt ... </code></pre> <p>前几个字母代表基因,后几个字母代表Uniprot编号(唯一的蛋白质标识符)和突变输出是不言自明的。你知道吗</p> <p>在Python中,我要执行以下行:</p> <pre><code>f_outputfile.write(mutation_directory + SOMETHING +line[1+i]+"_MutationOutput.txt\n") </code></pre> <p>这里,<code>line[1+i]</code>正确地标识Uniprot ID</p> <p>我要做的是正确识别基因名。因此,我需要快速搜索该目录,在uniprot字段中找到具有<code>line[i+1]</code>值的文件,然后取出基因名。你知道吗</p> <p>我知道我可以列出目录中的所有文件,然后我可以对每个字符串执行<code>str.split()</code>操作并找到它。但有没有办法让我更聪明?我应该用字典吗?我能快速搜索一下正则表达式吗?你知道吗</p> <p>整个目录大约有8116个文件——所以没有那么多。你知道吗</p> <p>谢谢你的帮助!你知道吗</p>
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匿名
1天前
擅长:python、mysql、java
<p>你可以用glob</p> <pre><code>In [4]: import glob In [5]: files = glob.glob('*_Q9UNA3_*') In [6]: files Out[6]: ['A4GNT_Q9UNA3_MutationOutput.txt'] </code></pre>
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