我有一个吸光度值矩阵,我从一大堆光谱中提取出来。我称这个矩阵为“specdt”
每行表示特定波长下多个样本的值。我想根据一个单独的浓度值数组“concentration”,找出回归的r^2值
以下是我目前掌握的情况:
regression = []
for row in specdt:
x = Concentration
y = specdt[row,:]
slope, intercept, r_value, p_value, std_err = stats.linregress(x,y)
regression.append(r_value**2)
regression_n = numpy.asarray(regression)
numpy.savetxt("r2_2.csv", regression_n, delimiter=",")
我得到一个错误:
Traceback (most recent call last):
file "blah blah", line 42, in <module>
y = specdt[row,:]
InexError: arrays used as indices must be of integer (or boolean) type
我怀疑这是因为“row”不是整数,所以我尝试迭代一个“t”变量;运气不好。你知道吗
我怀疑这是我试图将行拉入linregresse的y值的方式,但我似乎找不到其他方法来实现这一点。你知道吗
任何建议都非常感谢!你知道吗
编辑:我应该提一下
y = row
是我第一个尝试的。你知道吗
它给了我以下错误:
Traceback (most recent call last):
File "C:\Users\ME\Downloads\Personal\Spectrometer\test\Spectrum3.py", line 42, in <module>
slope, intercept, r_value, p_value, std_err = stats.linregress(x,y)
File "C:\Python27\lib\site-packages\scipy\stats\_stats_mstats_common.py", line 92, in linregress
ssxm, ssxym, ssyxm, ssym = np.cov(x, y, bias=1).flat
File "C:\Python27\lib\site-packages\numpy\lib\function_base.py", line 2432, in cov
X = np.vstack((X, y))
File "C:\Python27\lib\site-packages\numpy\core\shape_base.py", line 230, in vstack
return _nx.concatenate([atleast_2d(_m) for _m in tup], 0)
ValueError: all the input array dimensions except for the concatenation axis must match exactly
concentration数组和行的维度应该相同。你知道吗
如果我拉出一个列(我转置了specdt),linregresse的工作会非常出色。这是工作代码,如果这有帮助的话:
##take only column 26 or the values for 2268; print stuff
#Absorbance2268 = spectral_data[:, 25]
#print(Absorbance2268.shape)
#print(Absorbance2268)
#
##manual entry of concentration values + array info
#conc =[0,0,0,0,0,6,6,6,6,6,6,6,6,6,6,8,8,8,8,8,10,10,10,10,10,4,4,4,4,4]
#Concentration = numpy.asarray(conc)
#
#print(Concentration.shape)
#print(Concentration)
#
##performing linear regression.
#x = Concentration
#y = Absorbance2268
#
#slope, intercept, r_value, p_value, std_err = stats.linregress(x,y)
#
#print "r-squared:", r_value**2
for
循环已经给出了行本身的内容。如果需要行索引,请使用相关问题 更多 >
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