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拓扑数据分析-从何开始
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<p>我最近发现“拓扑数据分析”(TDA)是一种可视化大型数据集的独特方法。这是斯坦福大学的一篇论文,在<a href="https://research.math.osu.edu/tgda/mapperPBG.pdf" rel="noreferrer">https://research.math.osu.edu/tgda/mapperPBG.pdf</a>结尾处有示例输出。</p> <p>我想产生类似的结果,但是在安装包、加载示例数据,然后执行几行(比如<a href="http://scikit-learn.org/" rel="noreferrer">http://scikit-learn.org/</a>示例)的网络上很难找到可运行的代码。我的语言偏好是Python,但也可以使用R。</p> <p>有没有人能够得到TDA的牵引力,如果有,对如何启动和运行代码有什么建议?</p>
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1 个回答
匿名
1天前
擅长:python、mysql、java
<p>对于可视化,<a href="http://cytoscape.org/" rel="nofollow">Cytoscape</a>有桌面和浏览器版本。</p> <p>它建议生成两个python库(Bioconductor和igraph)<a href="http://cytoscape.org/what_is_cytoscape.html" rel="nofollow">here</a>。</p>
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