直接呼叫SeqIO.parse命令（）in-for循环可以工作，但是预先单独使用它却不行？为什么？

Question

在python代码中，我直接调用SeqIO.parse命令（），运行良好：

from Bio import SeqIO
a = SeqIO.parse("a.fasta", "fasta")
records = list(a)

for asq in SeqIO.parse("a.fasta", "fasta"):
    print("Q")

但在这里，我首先存储SeqIO.parse命令（）变量（？）调用，然后尝试在我的循环中使用它，它不会运行：

from Bio import SeqIO
a = SeqIO.parse("a.fasta", "fasta")
records = list(a)

for asq in a:
    print("Q")

这是因为函数| |的输出SeqIO.parse命令（“a.fasta”，“fasta”）| |存储在“a”中与我直接调用它时不同吗？ 这里“a”的身份到底是什么。它是一个变量吗？是物体吗？函数实际返回什么？你知道吗

Answer 1

SeqIO.parse()返回一个普通的python生成器。Biopython模块的这一部分是用纯python编写的：

>>> from Bio import SeqIO
>>> a = SeqIO.parse("a.fasta", "fasta")
>>> type(a)
<class 'generator'>

一旦对生成器进行了迭代，就会发现它已耗尽。您不能倒带生成器，但如果不介意将其全部放在内存中，您可以将内容存储在list或dict中（如果需要随机访问，则很有用）。您可以使用SeqIO.to_dict(a)将记录id作为键，序列作为值存储在字典中。当然，只需重新构建再次调用SeqIO.parse()的生成器就可以避免将文件内容转储到内存中。你知道吗