如何让程序不抛出“错误：无法加载Floyd的算法库”

Question

你们大家还有一个问题-

因此，我试图让一个名为Pysomap的程序工作（它基本上是ISOMAP，但用于python）[http://web.vscht.cz/spiwokv/pysomap/])，我尽我所能地遵循指示，在Ubuntu、Windows和Fedora（预构建库）上构建它，但似乎无法让它工作。在windows（这是首选的实现平台）上，每次我转到python并导入pysomap时，它都会给出上述错误。有人知道怎么解决这个问题吗？你知道吗

谢谢

-日本

Answer 1

这个源代码已经有5年多的历史了，floyd的构建脚本看起来采用了硬编码的python2.4。你知道吗

很明显，您的floyd模块没有构建。您很可能需要返回到构建步骤并确保正确地生成了_floyd.so。你知道吗

如果构建正确，则不会失败：
python -c "import _floyd"

Answer 2

我看了代码，因为Isomap是一个很酷的算法。代码看起来不像是由熟悉Python的人编写的，整个floyd扩展模块编译有点粗制滥造——它实际上不是为我构建的，我很确定这就是你的问题（他们捕获模块的导入异常并打印出你给出的错误）。你知道吗

我将build_floyd.sh中的一些硬编码内容更改为系统的不同硬编码值。（一个合适的构建系统将使这变得不必要）。下面是我的Ubuntu系统的工作原理。我测试过了，运行正常。你知道吗

#!/bin/sh
# run this script to generate library for Floyd's
# algorithm library

echo "generating input files using SWIG ..."
swig -python floyd.i

echo "compiling ..."
# change compiler if you use other than gcc
gcc -c floyd.c floyd_wrap.c -I/usr/include/python2.6 -fPIC

echo "linking ..."
ld -shared floyd.o floyd_wrap.o -o _floyd.so 

#echo "for SELinux you must run chcon ..."
#chcon -t textrel_shlib_t _floyd.so 

您可能还需要将demo.py中的第一行更改为#!/usr/bin/env python。你知道吗

Answer 3

在pysomap目录中，创建设置.py包含以下内容的文件：

from distutils.core import setup, Extension

setup(name="pysomap",
      version="2007.07",
      url ="http://web.vscht.cz/spiwokv/pysomap/",
      description="A library for isometric feature mapping.",
      license='Unknown',
      author="Vojtech Spiwok",
      py_modules=["floyd", "pysomap"],
      ext_modules=[Extension('_floyd', ["floyd_wrap.c", "floyd.c"])]
      )

构建_floyd扩展（假设安装了与Python distutils兼容的C编译器）：

python setup.py build_ext  inplace

跑演示.py地址：

python demo.py

Calculating distance matrix ............    2.24 s
Using epsilon-isomap, epsilon = 0.500000, calculating 2-dimensional embedding
Calculating graph matrix ...............    1.21 s
Calculating the shortest path matrix ...    2.22 s
Multidimensionally scalling ............    7.11 s
                         
Total procedure ........................   12.79 s