在Markdown中运行Python代码

Question

在降价文档中有很多关于使用Python代码的信息。但这一切似乎都是为了演示Python代码片段，而不是创建好看的文档。

我不能把Python和Markdown组合在一个文档中吗，就像R和Markdown一样？

MWE公司：

Output some text from Python in **Markdown**:
```python
from sklearn.datasets import load_iris
from sklearn import tree
iris = load_iris()
clf = tree.DecisionTreeClassifier()
clf = clf.fit(iris.data, iris.target)
print(clf.predict_proba(iris.data[:1, :]))
```

编译这个：markdown_py markdown.txt

<p>Output some text from Python in <strong>Markdown</strong>:
<code>python
from sklearn.datasets import load_iris
from sklearn import tree
iris = load_iris()
clf = tree.DecisionTreeClassifier()
clf = clf.fit(iris.data, iris.target)
clf.predict_proba(iris.data[:1, :])</code></p>

它显示代码（很酷），但实际上并不运行它。

不能在Markdown中运行Python代码吗？如果没有，还有其他选择吗？

（使用Ubuntu的python markdown包。）

Answer 1

我刚找到一个解决办法：

将块用作：

<<engine='python', engine.path='python3'>>=
# python code
@

• 默认情况下，engine.path使用python可执行文件，在大多数Linux系统中，它仍然是python2。如果您想要Python 2，可以使用commit。
• 如果要输出命令代码，请不要忘记传递echo=FALSE，并且results='asis'，这样它就不会试图转义输出。

您可以在文档的开头使用以下块设置默认值：

<<r setup, include=FALSE>>=
knitr::opts_chunk$set(echo=FALSE, engine='whathaveyou', ...)
@

将文件另存为markdown.Rmd，并使用R和knitr编译它。它将使用Python运行Python代码。

R命令：rmarkdown::render('markdown.Rmd','output.html')

或者只使用RStudio。

附录：本机解决方案显然是Pweave：它与乳胶和标记一起工作。不过，我还没有试过。

Answer 2

从2018年起，CRAN-package ^{}将提供更好的解决方案。

与“Python”模块、类和函数的接口。当调用“Python”时，R数据类型会自动转换为其等效的“Python”类型。当值从“Python”返回到R时，它们将被转换回R类型。兼容所有版本的“Python”>；=2.7。