Python-从字符串转换负小数

Question

我需要读入大量的.txt文件，每个文件都包含一个十进制数（有些是正的，有些是负的），然后将它们附加到2个数组中（基因型和表型）。随后，我希望在scipy中对这些数组执行一些数学运算，但是负（'-'）符号会导致问题。具体来说，我无法将数组转换为float，因为“-”作为字符串读取，导致以下错误：

ValueError: could not convert string to float:

这是我目前编写的代码：

import linecache

gene_array=[]
phen_array=[]

for i in genotype:

   for j in phenotype:

      genotype='/path/g.txt'
      phenotype='/path/p.txt'

      g=linecache.getline(genotype,1)
      p=linecache.getline(phenotype,1)

      p=p.strip()
      g=g.strip()

      gene_array.append(g)
      phen_array.append(p)

  gene_array=map(float,gene_array)
  phen_array=map(float,phen_array)

在这一点上，我相当肯定是负面信号导致了这个问题，但我不清楚原因。我使用Linecache是这里的问题吗？有没有更好的替代方法？

结果

print gene_array

是

['-0.0448022516321286', '-0.0236187263814157', '-0.150505384829925', '-0.00338459268479522', '0.0142429109897682', '0.0286253352284279', '-0.0462358095345649', '0.0286232317578776', '-0.00747425206137217', '0.0231790239373428', '-0.00266935581919541', '0.00825077426011094', '0.0272744527203547', '0.0394829854063242', '0.0233109171715023', '0.165841084392078', '0.00259693465334536', '-0.0342590874424289', '0.0124600520095644', '0.0713627590092807', '-0.0189374898081401', '-0.00112750710611284', '-0.0161387333242288', '0.0227226505624106', '0.0382173405035751', '0.0455518646388402', '-0.0453048799717046', '0.0168570746329513']

Answer 1

问题似乎是空字符串或空格，从错误消息中可以明显看出

ValueError: could not convert string to float:

若要使其生效，请将地图转换为列表理解

gene_array=[float(e) for e in gene_array if e]
phen_array=[float(e) for e in phen_array if e]

空字符串表示

float(" ")或float("")将给出值错误，因此，如果gene_array或phen_array中的任何项有空格，则在转换为浮点时将引发错误

空字符串可能有很多原因，比如

• 空行或空行
• 开头或结尾的空行

Answer 2

这个问题绝对不是消极的迹象。Python可以毫无问题地转换带有负号的字符串。我建议您对float RegEx运行每个条目，看看它们是否都通过。

Answer 3

错误消息中没有任何内容表明问题出在-。最可能的原因是gene_array和/或phen_array包含空字符串（''）。

如文档中所述，linecache.getline()

will return '' on errors (the terminating newline character will be included for lines that are found).