从文件解析xml时出错，但不是字符串？Python

Question

我试图使用xml2dict来解析大量的xml文件，以便将它们转换为数据帧，但是，当我尝试解析实际的xml文件时，我得到了一个错误：

"ExpatError: not well-formed (invalid token): line 1, column 5"

这个错误对于所有的xml文件都是一样的，包括“第1行，第5列”，它们的长度相差很大，但结构都是相同的。在

当我试图将xml文件的内容复制为python中的字符串时，xml2dict的解析工作非常完美。例如：

^{pr2}$

在上面的例子中，nestdict1抛出错误，nestdict2没有问题，尽管xmlstr是来自文件'Train/DrugBank/Aciclovir_ddi.xml'的直接复制和粘贴

Answer 1

您需要传递一个file对象，而不是一个作为文件名的字符串。在

从docs：

In [4]:print(xmltodict.parse.__doc__)
Parse the given XML input and convert it into a dictionary.

    `xml_input` can either be a `string` or a file-like object.

因此，创建一个文件描述符，如下所示：

^{pr2}$

然后将其传递给parse方法：

x2d.parse(fd)