dask和pandas数据帧中apply的不兼容性

2024-04-25 15:26:14 发布

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我的Dask dataframe中的triggers列的示例如下所示:

0    [Total Traffic, DNS, UDP]
1                    [TCP RST]
2              [Total Traffic]
3                 [IP Private]
4                       [ICMP]
Name: triggers, dtype: object

我希望通过执行以下操作来创建上述数组的一个热编码版本(例如,在第1行的DNS列上放置一个1列)。pop_triggers包含triggers的所有可能值。在

^{pr2}$

但是,Total TrafficDNS等列都包含相关值的值0,而不是1。当我将它复制到pandas数据帧并执行相同的操作时,它们将获得预期值。在

a = df[[ 'Total Traffic', 'UDP', 'NTP Amplification', 'triggers', 'ICMP']].head()
for trig in pop_triggers:
    a[trig] = a.triggers.apply(lambda x: 1 if trig in x else 0)

我错过了什么?是因为dask很懒,所以它没有按预期填写值吗?在

编辑1: 我调查了一些一开始设置国旗的地方(结果发现远远低于我的预期,得到了一些非常奇怪的结果。见下文:

df2 = df[df['Total Traffic']==1]
df2[['triggers']+pop_triggers].head()

输出:

        triggers    Total Traffic   UDP DNS
9380    [ICMP, IP null, IP Private, TCP null, TCP SYN,...   1   1   1
9388    [ICMP, IP null, IP Private, TCP null, TCP SYN,...   1   1   1
19714   [ICMP, IP null, IP Private, UDP, NTP Amplifica...   1   1   1
21556   [IP null]   1   1   1
21557   [IP null]   1   1   1

可能的bug?

编辑2: 最小工作示例:

triggers = [['Total Traffic', 'DNS', 'UDP'],['TCP RST'],['Total Traffic'],['IP Private'],['ICMP']]*10
df2 = dd.from_pandas(pd.DataFrame({'triggers':triggers}), npartitions=16)
pop_triggers= ['Total Traffic', 'UDP', 'DNS', 'TCP SYN', 'TCP null', 'ICMP']
for trig in pop_triggers:
    df2[trig] = df2.triggers.apply(lambda x: 1 if trig in x else 0)
df2.head()

输出:

triggers    Total Traffic   UDP DNS TCP SYN TCP null    ICMP
0   [Total Traffic, DNS, UDP]   0   0   0   0   0   0
1   [TCP RST]   0   0   0   0   0   0
2   [Total Traffic] 0   0   0   0   0   0
3   [IP Private]    0   0   0   0   0   0

注意:我更关心的是达斯克的一面,而不是熊猫


Tags: inipdnsprivatepopnulltcptotal
1条回答
网友
1楼 · 发布于 2024-04-25 15:26:14

根据我的经验,apply中的dask与显式^{}一起工作得更好。有一些功能可以让dask尝试猜测metadata,但我发现它速度慢,而且不总是可靠的。另外,指导原则是指定meta。在

我的另一点经验是assigndf[col] = ...工作得更好。我不确定这是一个bug、一个限制还是一个误用(我前一段时间研究过了,我不认为这是一个bug)。在

编辑:第一个模式不起作用,循环中用于前几列的trig值似乎被更新了,因此在计算时,这只给出所有列的最后一个值的结果!在

这不是一个bug,而是没有立即计算的组合,而lambda结果是延迟计算对闭包的尚未计算。请参见this discussion了解它为什么不起作用。在

我的模式是:

cols = {}
for trig in pop_triggers:
    meta = (trig, int)
    cols[trig] = df.triggers.apply(lambda x: 1 if trig in x else 0, meta=meta)
df = df.assign(**cols)

正确模式:

(抱歉,之前没有测试,因为我运行的是相同的模式,除了我没有在应用的函数中使用循环值,所以没有面对这种行为)

^{pr2}$

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