Pygraphviz/Python3/Mac:类型E

Question

我一直试图让Pygraphviz在Mac上使用Python3，但我无法解决一个类型错误。在

具体来说，以下代码的输出（Python3/eclipseneon/macos10.10.5，改编自here教程）

import networkx as nx
import queueing_tool as qt
import pygraphviz as pgv

a = pgv.AGraph()
print(a._get_prog('fdp'))

g = qt.generate_random_graph(200, seed=3)
q = qt.QueueNetwork(g, seed=3)
q.max_agents = 20000
q.initialize(100)
q.simulate(10000)

pos = nx.nx_agraph.graphviz_layout(g.to_undirected(), prog='neato')

是以下错误：

^{pr2}$

如果我使用Python2.7.x运行相同的代码（只需要将“print（arg）”更改为“print arg”），我将得到以下输出（大量警告，但它可以工作）：

/usr/local/bin/fdp
/usr/local/lib/python2.7/site-packages/pygraphviz/agraph.py:1338: RuntimeWarning: Warning: node 0, position [ 5.50797903  7.08147823], expected two floats
Warning: node 12, position [ 5.44649018  7.80314765], expected two floats
[... here other warnings of the same kind]
Warning: Overlap value "prism" unsupported - ignored

  warnings.warn(b"".join(errors), RuntimeWarning)

所以我的问题是，如何让pygraphviz也能和Python3一起工作呢？我不知道去哪儿找。请注意，在从终端或Eclipse运行上述代码时，我得到的错误没有区别。在

是否与Python3不相容？我记得几年前有人告诉我，出于“科学目的”，使用Python2.x可能还是更好的。现在是这样吗？在

提前谢谢你的帮助！在

Answer 1

python3中出现了graphviz错误的字节/字符串处理错误错误。修复程序已包含在pygraphviz github主分支中（https://github.com/pygraphviz/pygraphviz/pull/104）。你可以从https://github.com/pygraphviz/pygraphviz下载，直到我们发布新版本。在

注意，pygraphviz可以正确地使用Python3。在