单叶树状图叶节点排序

Question

我试图更改Scipy dendrogram绘图函数中叶节点的顺序。考虑以下片段：

from scipy.cluster.hierarchy import linkage, dendrogram
import matplotlib.pyplot as plt
dists = [ 2., 10.,  3.]
lx = linkage(dists, 'complete')
dendrogram(lx)
plt.show()

结果图为树状图：

我想将这个图中叶节点的顺序改为0, 1, 2。有没有一个简单的方法来实现这一点？在

我尝试了count_sort和distance_sort参数的所有可能设置，但顺序保持不变。在

Answer 1

我不认为这是可能的。count_sort和distance_sort选项仅适用于子代节点。

想象一下你的例子，标签1和标签2是交换的。在这种情况下，不可能按顺序排列节点，因为节点1需要在成对节点0和1之间强制执行。这表明，对所有节点排序的任何过程都是不可伸缩的。

Answer 2

以下注释出现在source code of the dendrogram scipy method中：

# This feature was thought about but never implemented (still useful?):
#
#         ... = dendrogram(..., leaves_order=None)
#
#         Plots the leaves in the order specified by a vector of
#         original observation indices. If the vector contains duplicates
#         or results in a crossing, an exception will be thrown. Passing
#         None orders leaf nodes based on the order they appear in the
#         pre-order traversal.

所以这是一个相关的问题。您可以联系Scipy开发人员（SciPy Project Mailing Lists）来表达您对这个增强的兴趣，这样他们就会意识到它是有用的，并给予它更高的优先级。