Seaborn Clustermap，内核在计算过程中死亡

Question

我有一个这样的数据帧：

              value_1   value_2
test_id                        
A1BG        -0.956960      -inf
A1BG-AS1    -1.186835 -1.689504
A1CF        -2.941882      -inf
A2M          0.966581  1.031764
A2M-AS1     -1.188544 -1.231258
A2ML1            -inf -1.787149
A2MP1            -inf      -inf
A3GALT2     -0.885212 -0.587419
A4GALT       0.981555  0.876730
A4GNT            -inf      -inf
AA06             -inf      -inf
AAAS         1.364746  1.410399
AACS         1.044108  0.983331
AACSP1      -1.421534 -1.514185

它大约有25000排。现在我想把它画成一个有聚类的热图。我使用了以下命令：

^{pr2}$

但唯一会发生的事情是：

Kernel died, restarting

我错过了什么？在

Answer 1

根据注释，解决方案是将Data.fillna(0)分配给一个新变量，或者将其与inplace=True一起使用。在这种特殊情况下，在记录元素（log(data + small_number)）之前，替换np.inf或添加一个小数字也更合适。在