Snakem中Currentrule的名称

Question

我正在使用Snakemake，我无法找到访问当前规则名称的方法。在

例如，有没有一种方法可以这样访问：

rule job1:
    input: check_inputs(rules.current.name)
    output: ...

当check_inputs函数对每个规则或多或少都相同时，这将非常有用。在

当然，这是我做的，而且很管用：

^{pr2}$

但是，我想知道是否存在一种更“蛇行”的方法来获取当前规则的名称，以避免每次写入/硬编码规则名称。在

如有任何帮助或建议，我们将不胜感激。在

编辑---
{{cd4}>只有当cd4}>被{rules.myrule.name}在input/output定义中是不可能使用的。在

这样做的目的是快速访问当前规则的名称{rules.current}，因为{rules.myrule.name}也是重复的。在

Answer 1

我认为rule.name应该可以工作，但是看起来它只是rule，但是它不能在所有上下文中使用：请参见https://bitbucket.org/snakemake/snakemake/issues/199/rule-name-cant-be-accessed-by-rule-in

安德烈亚斯

Answer 2

（编辑：提出了一个解决办法）

在shell:/run:指令期间，{rule}可用于rulename。正如op所说，这在input/output:中不起作用。然而，当前的模板是一个完整的工作

myrule = "foo"
rule foo:
    output: touch(myrule + ".ok")
    shell:
        'echo "I am {rule}, making {output}"'

在上面的例子中，引入变量myrule是不必要的，因为它只使用一次。但是，当您希望在各种snakemake指令中多次使用规则名称时，这就更有意义了。而且它也有助于规则模板化。在