通过python提交LSF脚本子流程.Popen（）无外壳=Tru

Question

预先警告，问题可能更多的是对bsub命令和登录shell的理解不足，而不是python的Popen()。在

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我试图在python脚本中使用subprocess.Popen()提交一个LSF脚本

pipe = subprocess.Popen(shlex.split("bsub < script.lsf"),
                        stdout=subprocess.PIPE, stderr=subprocess.PIPE)

似乎一个子进程已经正确启动并执行了该命令，但是我从bsub命令中得到了一个错误stderr，它显示“Empty job”。作业未提交。“

我担心它与启动登录shell的子进程有关，所以我尝试在Popen命令中使用shell=True来缓解这种情况。在

^{pr2}$

这将按预期成功提交作业。所以我的问题是如何在不使用shell=True的情况下提交此作业？在

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我试过使用一些bsub options，比如

pipe = subprocess.Popen(shlex.split("bsub -L /bin/sh < script.lsf"),
                        stdout=subprocess.PIPE, stderr=subprocess.PIPE)

同样的“空工作”。作业未提交。”返回错误。我觉得这很接近我想要的，但是我不完全理解“登录shell的名称（必须指定一个绝对路径）”到底是什么。可能我正在使用的系统上没有/bin/sh。有办法打印这个路径吗？在

Answer 1

<和>不是命令的参数（在本例中是bsub），而是对shell的指示，说明在该命令启动之前stdin或stdout（分别）应指向何处。在

因此，适当的替代方法是使用Popen的单独参数指定此重定向：

pipe = subprocess.Popen(['bsub', '-L', '/bin/sh'],
                        stdout=subprocess.PIPE, stderr=subprocess.PIPE,
                        stdin=open('script.lsf', 'r'))