Numpy hstack-“ValueError:所有输入数组必须具有相同的维数”-但是它们

Question

我正在尝试加入两个numpy数组。在其中一个例子中，我在一列文本上运行TF-IDF之后拥有一组列/特性。另一个是一个列/特性，它是一个整数。所以我读了一列训练和测试数据，在上面运行TF-IDF，然后我想添加另一个整数列，因为我认为这将帮助我的分类器更准确地了解它的行为。

不幸的是，当我试图运行hstack将这个列添加到另一个numpy数组时，标题中出现了错误。

这是我的代码：

  #reading in test/train data for TF-IDF
  traindata = list(np.array(p.read_csv('FinalCSVFin.csv', delimiter=";"))[:,2])
  testdata = list(np.array(p.read_csv('FinalTestCSVFin.csv', delimiter=";"))[:,2])

  #reading in labels for training
  y = np.array(p.read_csv('FinalCSVFin.csv', delimiter=";"))[:,-2]

  #reading in single integer column to join
  AlexaTrainData = p.read_csv('FinalCSVFin.csv', delimiter=";")[["alexarank"]]
  AlexaTestData = p.read_csv('FinalTestCSVFin.csv', delimiter=";")[["alexarank"]]
  AllAlexaAndGoogleInfo = AlexaTestData.append(AlexaTrainData)

  tfv = TfidfVectorizer(min_df=3,  max_features=None, strip_accents='unicode',  
        analyzer='word',token_pattern=r'\w{1,}',ngram_range=(1, 2), use_idf=1,smooth_idf=1,sublinear_tf=1) #tf-idf object
  rd = lm.LogisticRegression(penalty='l2', dual=True, tol=0.0001, 
                             C=1, fit_intercept=True, intercept_scaling=1.0, 
                             class_weight=None, random_state=None) #Classifier
  X_all = traindata + testdata #adding test and train data to put into tf-idf
  lentrain = len(traindata) #find length of train data
  tfv.fit(X_all) #fit tf-idf on all our text
  X_all = tfv.transform(X_all) #transform it
  X = X_all[:lentrain] #reduce to size of training set
  AllAlexaAndGoogleInfo = AllAlexaAndGoogleInfo[:lentrain] #reduce to size of training set
  X_test = X_all[lentrain:] #reduce to size of training set

  #printing debug info, output below : 
  print "X.shape => " + str(X.shape)
  print "AllAlexaAndGoogleInfo.shape => " + str(AllAlexaAndGoogleInfo.shape)
  print "X_all.shape => " + str(X_all.shape)

  #line we get error on
  X = np.hstack((X, AllAlexaAndGoogleInfo))

以下是输出和错误消息：

X.shape => (7395, 238377)
AllAlexaAndGoogleInfo.shape => (7395, 1)
X_all.shape => (10566, 238377)



---------------------------------------------------------------------------
ValueError                                Traceback (most recent call last)
<ipython-input-12-2b310887b5e4> in <module>()
     31 print "X_all.shape => " + str(X_all.shape)
     32 #X = np.column_stack((X, AllAlexaAndGoogleInfo))
---> 33 X = np.hstack((X, AllAlexaAndGoogleInfo))
     34 sc = preprocessing.StandardScaler().fit(X)
     35 X = sc.transform(X)

C:\Users\Simon\Anaconda\lib\site-packages\numpy\core\shape_base.pyc in hstack(tup)
    271     # As a special case, dimension 0 of 1-dimensional arrays is "horizontal"
    272     if arrs[0].ndim == 1:
--> 273         return _nx.concatenate(arrs, 0)
    274     else:
    275         return _nx.concatenate(arrs, 1)

ValueError: all the input arrays must have same number of dimensions

是什么导致了我的问题？我该怎么解决？据我所知，我应该能够加入这些列？我误解了什么？

谢谢你。

编辑：

使用下面答案中的方法将得到以下错误：

---------------------------------------------------------------------------
ValueError                                Traceback (most recent call last)
<ipython-input-16-640ef6dd335d> in <module>()
---> 36 X = np.column_stack((X, AllAlexaAndGoogleInfo))
     37 sc = preprocessing.StandardScaler().fit(X)
     38 X = sc.transform(X)

C:\Users\Simon\Anaconda\lib\site-packages\numpy\lib\shape_base.pyc in column_stack(tup)
    294             arr = array(arr,copy=False,subok=True,ndmin=2).T
    295         arrays.append(arr)
--> 296     return _nx.concatenate(arrays,1)
    297 
    298 def dstack(tup):

ValueError: all the input array dimensions except for the concatenation axis must match exactly

有趣的是，我试图打印X的dtype，结果很好：

X.dtype => float64

但是，尝试按如下方式打印AllAlexaAndGoogleInfo的数据类型：

print "AllAlexaAndGoogleInfo.dtype => " + str(AllAlexaAndGoogleInfo.dtype) 

产生：

'DataFrame' object has no attribute 'dtype'

Answer 1

使用.column_stack。就像这样：

X = np.column_stack((X, AllAlexaAndGoogleInfo))

从docs：

Take a sequence of 1-D arrays and stack them as columns to make a single 2-D array. 2-D arrays are stacked as-is, just like with hstack.

Answer 2

由于X是稀疏数组，因此使用scipy.sparse.hstack来连接数组，而不是numpy.hstack。在我看来，这个错误信息有点误导人。

这个最小的例子说明了这种情况：

import numpy as np
from scipy import sparse

X = sparse.rand(10, 10000)
xt = np.random.random((10, 1))
print 'X shape:', X.shape
print 'xt shape:', xt.shape
print 'Stacked shape:', np.hstack((X,xt)).shape
#print 'Stacked shape:', sparse.hstack((X,xt)).shape #This works

基于以下输出

X shape: (10, 10000)
xt shape: (10, 1)

人们可能希望下面这行中的hstack可以工作，但事实是它抛出了这个错误：

ValueError: all the input arrays must have same number of dimensions

因此，当有稀疏数组要堆栈时，请使用scipy.sparse.hstack。

---

事实上，我已经在你的另一个问题中作为评论回答了这个问题，你提到另一个错误信息弹出：

TypeError: no supported conversion for types: (dtype('float64'), dtype('O'))

首先，AllAlexaAndGoogleInfo没有dtype，因为它是DataFrame。要获得它的底层numpy数组，只需使用AllAlexaAndGoogleInfo.values。检查它的dtype。根据错误消息，它有一个dtype的object，这意味着它可能包含字符串等非数字元素。

这是一个最小的例子，再现了这种情况：

X = sparse.rand(100, 10000)
xt = np.random.random((100, 1))
xt = xt.astype('object') # Comment this to fix the error
print 'X:', X.shape, X.dtype
print 'xt:', xt.shape, xt.dtype
print 'Stacked shape:', sparse.hstack((X,xt)).shape

错误消息：

TypeError: no supported conversion for types: (dtype('float64'), dtype('O'))

因此，在进行叠加之前，检查AllAlexaAndGoogleInfo中是否有任何非数值，并修复它们。

Answer 3

尝试：

X = np.hstack((X, AllAlexaAndGoogleInfo.values))

我没有正在运行的熊猫模块，所以无法测试它。但是DataFrame文档描述了values Numpy representation of NDFrame。np.hstack是一个numpy函数，因此对DataFrame的内部结构一无所知。