距离矩阵到Newick形式的转换

2024-04-20 05:42:35 发布

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我的最终目标是把热图和系统进化树结合起来。我已经完成了热图,我还发现了BioPython中的ETE2包,它可以帮助我合并两种类型的图,但是ETE2需要Newick格式(树型)而不是距离矩阵(我有)作为输入。有没有人知道有一个模块可以帮助我做到这一点?在


Tags: 模块距离类型系统格式矩阵热图biopython
1条回答
网友
1楼 · 发布于 2024-04-20 05:42:35

在生物星中似乎有一个thread的信息。它指向一个answer来转换这些格式,然后跟随ETE邮件列表的this discussion。在

我在网上找到了this converter,我不确定它是否适合你。在


要求找到一个工具是offtopic,我刚做了一个谷歌调查。。。在

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